More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05796 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_05796  phospholipase D active site domain protein  100 
 
 
404 aa  822    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.77 
 
 
420 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  50.69 
 
 
420 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  52.31 
 
 
427 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  51.43 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  51.15 
 
 
419 aa  200  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  44.91 
 
 
446 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.62 
 
 
425 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.97 
 
 
427 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  36.23 
 
 
436 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.39 
 
 
462 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  33.18 
 
 
474 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.43 
 
 
477 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.13 
 
 
458 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.49 
 
 
478 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.66 
 
 
445 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  34.43 
 
 
480 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  33.02 
 
 
489 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  33.67 
 
 
475 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  29.63 
 
 
480 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.83 
 
 
482 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  32.71 
 
 
492 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.31 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  36.42 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.31 
 
 
395 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  30.84 
 
 
483 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  32.49 
 
 
439 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.38 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  37.09 
 
 
385 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  34.17 
 
 
478 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.09 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  37.75 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  30.09 
 
 
477 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 
486 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.2 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  30.21 
 
 
406 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.26 
 
 
474 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.14 
 
 
480 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.65 
 
 
478 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  36.42 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  31.88 
 
 
478 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  34.44 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.88 
 
 
478 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.06 
 
 
483 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  37.09 
 
 
385 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  35.76 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  34.97 
 
 
481 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.86 
 
 
481 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  32.2 
 
 
502 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 
473 aa  93.2  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  32.97 
 
 
486 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.53 
 
 
485 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
514 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
514 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
514 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
514 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.24 
 
 
502 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
514 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
514 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.11 
 
 
514 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.33 
 
 
489 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 
514 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  29.11 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  36.18 
 
 
497 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
514 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
486 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  28.91 
 
 
478 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  31.51 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
492 aa  90.9  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.75 
 
 
392 aa  89.7  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.73 
 
 
484 aa  90.1  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  31.96 
 
 
476 aa  89.7  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.96 
 
 
476 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 
514 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3435  phospholipase D/transphosphatidylase  32.06 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358165  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.13 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  32.7 
 
 
502 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  27.98 
 
 
478 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  34.27 
 
 
426 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  32.24 
 
 
476 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  36.73 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.43 
 
 
483 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  35.76 
 
 
359 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  31.16 
 
 
491 aa  87.4  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  29.57 
 
 
555 aa  87  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  30 
 
 
532 aa  86.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.84 
 
 
492 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.13 
 
 
472 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  32.69 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  37.76 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.88 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.54 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.78 
 
 
474 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  32.54 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.66 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  32.54 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.78 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  31.02 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>