More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2449 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
392 aa  787    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  52.23 
 
 
392 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  48.81 
 
 
385 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  49.48 
 
 
385 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  47.53 
 
 
385 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  50.94 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  47.12 
 
 
385 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  48.03 
 
 
386 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  46.6 
 
 
385 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  48.94 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  46.86 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  47.24 
 
 
385 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  46.72 
 
 
385 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  49.17 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  37.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  35.56 
 
 
462 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  35.98 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  37.4 
 
 
451 aa  196  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.2 
 
 
420 aa  195  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  35.44 
 
 
490 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  35.71 
 
 
491 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.52 
 
 
420 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  32.34 
 
 
420 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  33.42 
 
 
458 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  33.42 
 
 
436 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.24 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  32.86 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  35.84 
 
 
480 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
481 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.68 
 
 
526 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.54 
 
 
490 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  35.96 
 
 
406 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  36.09 
 
 
396 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.89 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  37.79 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.75 
 
 
425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  33.79 
 
 
383 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  36.94 
 
 
403 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.33 
 
 
509 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.33 
 
 
509 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  36.19 
 
 
475 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.33 
 
 
509 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 
514 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.04 
 
 
486 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  38.46 
 
 
400 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  36.23 
 
 
401 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.33 
 
 
509 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  34.38 
 
 
416 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.4 
 
 
479 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 
509 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 
509 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  37.01 
 
 
405 aa  177  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 
509 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.59 
 
 
479 aa  176  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  34.43 
 
 
483 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.17 
 
 
502 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  37.31 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  36.52 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.05 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  28.88 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  32.29 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 
509 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.15 
 
 
483 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  37.57 
 
 
413 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.5 
 
 
479 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  31.67 
 
 
446 aa  173  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30 
 
 
514 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  39.81 
 
 
422 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.14 
 
 
481 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  33.05 
 
 
484 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.5 
 
 
479 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  37.5 
 
 
400 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 
481 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  36.96 
 
 
476 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  35.03 
 
 
461 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  34.27 
 
 
424 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  31.68 
 
 
406 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  31.28 
 
 
479 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.5 
 
 
476 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.05 
 
 
483 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  34.27 
 
 
424 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.1 
 
 
478 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
479 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
479 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
479 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  32.4 
 
 
479 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
479 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
479 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
479 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
479 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>