More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2285 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 400 aa  815    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  67.96 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  67.96 
 
 		 400 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  67.7 
 
 		 400 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  67.44 
 
 		 400 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  60.15 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  64.6 
 
 		 401 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  60.82 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  64.08 
 
 		 401 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  58.88 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  56.49 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  54.52 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  53.61 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  54.36 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  52.14 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  52.14 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  52.14 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  52.14 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  51.89 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  55.36 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  53.23 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  54.11 
 
 		 403 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  53.6 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  50.6 
 
 		 413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  50.6 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  50.36 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  50.12 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  50.36 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  50.36 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  50.6 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  50.36 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  50.61 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  50.36 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  56.61 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  57.85 
 
 		 363 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  47.53 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  52.54 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  38.32 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  40.11 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  37.3 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  35.89 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 		 461 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  40.95 
 
 		 442 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.21 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  36.64 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  37.62 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.16 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.68 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  35.59 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.34 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  38.42 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  37.02 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  37.02 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  37.02 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  37.29 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  38.04 
 
 		 439 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  37.47 
 
 		 426 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  37.29 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  37.29 
 
 		 424 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  37.57 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.8 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.59 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  34.99 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  39.09 
 
 		 481 aa  176  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  36.34 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  37.06 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  37.74 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  37.71 
 
 		 419 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.86 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  33.91 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  33.82 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  35.95 
 
 		 479 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  38.6 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  38.6 
 
 		 410 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  34.88 
 
 		 420 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.43 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  38.6 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  38.6 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  38.6 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.13 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  38.6 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  38.6 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  33.14 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  33.73 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  34.56 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.28 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  35.98 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.06 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  37.04 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  36.31 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  35.99 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  31.49 
 
 		 484 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  35.67 
 
 		 481 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.52 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.67 
 
 		 472 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 		 477 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 		 477 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.86 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1870  cardiolipin synthetase  29.43 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0003289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>