More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0878 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  99.02 
 
 		 409 aa  808    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 409 aa  816    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  74.06 
 
 		 410 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  74.19 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  59.8 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  61.71 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  59.32 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  48.1 
 
 		 461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  44.95 
 
 		 383 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  48 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  46.75 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  48 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  46.19 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  44.25 
 
 		 396 aa  279  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  41.83 
 
 		 426 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  43.14 
 
 		 419 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.39 
 
 		 419 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  42.68 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  41.62 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  42.75 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  41.37 
 
 		 451 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  42.2 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  42.22 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  42.25 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  42.25 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  41.94 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.78 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  37.12 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  39.78 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  45.88 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  42.18 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  42.18 
 
 		 410 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  42.04 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  42.04 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  42.18 
 
 		 424 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  42.18 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  42.18 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  42.18 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  41.93 
 
 		 401 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  37.15 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  37.15 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  36.9 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  36.9 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  40.79 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  36.64 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  36.64 
 
 		 413 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  37.31 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  39.02 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  36.39 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  36.39 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  36.39 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  37.05 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  40.16 
 
 		 403 aa  203  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  39.89 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  36.18 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  38.6 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  39.1 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  36.79 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  36.67 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  40.26 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  39.67 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  39.57 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  39.4 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  35.83 
 
 		 401 aa  186  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  34.09 
 
 		 416 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  36.08 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  38.84 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  39.1 
 
 		 416 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  34.2 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.99 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  30.87 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  32.01 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  29.95 
 
 		 462 aa  153  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 482 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  31.15 
 
 		 486 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  32.47 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.8 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  28.39 
 
 		 502 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.34 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.92 
 
 		 492 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  30.71 
 
 		 486 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  27.88 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  30.45 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.22 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  27.98 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.08 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  30.26 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  27.58 
 
 		 484 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.53 
 
 		 420 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  27.86 
 
 		 485 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  31.78 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  31.81 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  31.07 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.64 
 
 		 478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>