More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07550 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  100 
 
 
410 aa  837    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  58.42 
 
 
412 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  55.69 
 
 
413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  56.38 
 
 
417 aa  438  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  57.75 
 
 
432 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.47 
 
 
453 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  50.61 
 
 
419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  47.83 
 
 
406 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  49.48 
 
 
426 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  45.34 
 
 
422 aa  313  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  36.55 
 
 
417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  36.76 
 
 
499 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.23 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  33.84 
 
 
396 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  31.64 
 
 
476 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  31.56 
 
 
476 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.97 
 
 
483 aa  206  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.36 
 
 
485 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  36.8 
 
 
396 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.63 
 
 
462 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 
541 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  32.45 
 
 
490 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  32.61 
 
 
481 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  31.93 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.98 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  30.16 
 
 
487 aa  197  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  30.41 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  33.69 
 
 
477 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.93 
 
 
509 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  28.16 
 
 
470 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 
509 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.88 
 
 
526 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 
514 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.65 
 
 
514 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  29.52 
 
 
397 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 
509 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 
509 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.57 
 
 
514 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 
509 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.93 
 
 
509 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.41 
 
 
509 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 
514 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 
514 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 
514 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.57 
 
 
514 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 
514 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 
514 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 
514 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 
509 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.59 
 
 
502 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.59 
 
 
502 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  35.18 
 
 
396 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.91 
 
 
509 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 
514 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  32.53 
 
 
458 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.99 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
488 aa  188  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  34.45 
 
 
420 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
487 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.52 
 
 
508 aa  186  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31 
 
 
485 aa  186  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  31.87 
 
 
494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  31.87 
 
 
494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.11 
 
 
495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.84 
 
 
498 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 
487 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 
481 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.55 
 
 
463 aa  183  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  31.15 
 
 
480 aa  183  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.62 
 
 
397 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  32.35 
 
 
480 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.28 
 
 
420 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  29.08 
 
 
397 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 
479 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  34.45 
 
 
372 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.8 
 
 
397 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  28.8 
 
 
397 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.8 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.8 
 
 
397 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.8 
 
 
397 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  29.65 
 
 
479 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.99 
 
 
481 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.06 
 
 
395 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.61 
 
 
474 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 
474 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  28.53 
 
 
397 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  29.59 
 
 
479 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  33.92 
 
 
481 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.45 
 
 
478 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.49 
 
 
484 aa  176  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
479 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.61 
 
 
374 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  29.59 
 
 
479 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  33.43 
 
 
475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.16 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.56 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  32.94 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  33.15 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>