More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2817 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
412 aa  828    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  69.25 
 
 
413 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  59.14 
 
 
417 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  60.9 
 
 
432 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  56.68 
 
 
453 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  55.58 
 
 
419 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  58.56 
 
 
410 aa  451  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  53.61 
 
 
426 aa  395  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  49 
 
 
406 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  48.45 
 
 
422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  38.82 
 
 
417 aa  279  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  35.96 
 
 
462 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  35.14 
 
 
499 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  33.33 
 
 
487 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  34.68 
 
 
458 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.15 
 
 
483 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  33.96 
 
 
488 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.56 
 
 
445 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  34.23 
 
 
485 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.24 
 
 
482 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.4 
 
 
476 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.81 
 
 
541 aa  196  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  32.13 
 
 
483 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  30.89 
 
 
476 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.58 
 
 
472 aa  193  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.49 
 
 
470 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.19 
 
 
485 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  30.6 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 
490 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.75 
 
 
397 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  30.1 
 
 
397 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  30.1 
 
 
397 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  30.46 
 
 
397 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  30.46 
 
 
397 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  31.97 
 
 
396 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  30.2 
 
 
397 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  33.77 
 
 
480 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  33.25 
 
 
475 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  30.87 
 
 
509 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.4 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  31.55 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  31.1 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.79 
 
 
505 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.79 
 
 
505 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  33.7 
 
 
372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  31.28 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.81 
 
 
396 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5469  cardiolipin synthetase domain protein  30.35 
 
 
397 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  31.45 
 
 
509 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.07 
 
 
508 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.95 
 
 
395 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  34.3 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.71 
 
 
478 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.49 
 
 
477 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  28.9 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  32.89 
 
 
490 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  29.81 
 
 
502 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  32.33 
 
 
436 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.05 
 
 
514 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  32.87 
 
 
420 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.73 
 
 
478 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  35.73 
 
 
478 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  31.99 
 
 
490 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  33.61 
 
 
420 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.05 
 
 
514 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.97 
 
 
374 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5483  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
371 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  hitchhiker  6.83583e-18 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  32.57 
 
 
474 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  28.95 
 
 
483 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.4 
 
 
420 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
514 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
514 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
514 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
514 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
514 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.88 
 
 
420 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
477 aa  176  9e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.73 
 
 
502 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  28.95 
 
 
483 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  32.53 
 
 
486 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.61 
 
 
483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.52 
 
 
514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.48 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.79 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  31.44 
 
 
486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
478 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  31.75 
 
 
396 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.32 
 
 
474 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>