More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4096 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
413 aa  837    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  69.25 
 
 
412 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  58.78 
 
 
417 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  54.68 
 
 
453 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  57.61 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  54.24 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  58.45 
 
 
410 aa  438  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  49.75 
 
 
406 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  48.71 
 
 
426 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  48.08 
 
 
422 aa  343  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 
417 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.51 
 
 
462 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  34.15 
 
 
488 aa  210  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  33.33 
 
 
458 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.43 
 
 
445 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  32.7 
 
 
494 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  32.7 
 
 
494 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.78 
 
 
485 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.36 
 
 
482 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.42 
 
 
396 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
485 aa  196  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  33.15 
 
 
499 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.17 
 
 
472 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  31.61 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  30.71 
 
 
487 aa  190  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.34 
 
 
505 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.34 
 
 
505 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.86 
 
 
476 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  31.69 
 
 
490 aa  186  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.72 
 
 
477 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  34.33 
 
 
477 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.34 
 
 
374 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.49 
 
 
483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.86 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.49 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  35.52 
 
 
514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  32.88 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  33.62 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  34.01 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  31.59 
 
 
486 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  31.34 
 
 
486 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.58 
 
 
478 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  31.94 
 
 
473 aa  182  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  32.88 
 
 
475 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.97 
 
 
477 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.07 
 
 
474 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  30.85 
 
 
486 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  35.22 
 
 
479 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  29.93 
 
 
474 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 
481 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
470 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.82 
 
 
487 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  33.71 
 
 
479 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  29.95 
 
 
490 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  33.42 
 
 
396 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  33.43 
 
 
481 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  33.43 
 
 
479 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.46 
 
 
395 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  32.26 
 
 
420 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  34.01 
 
 
478 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.09 
 
 
487 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  32.88 
 
 
478 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.04 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.21 
 
 
481 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.03 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.2 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.37 
 
 
509 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.37 
 
 
509 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  34.73 
 
 
490 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 
420 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.23 
 
 
479 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.3 
 
 
509 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.3 
 
 
509 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
478 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  28.73 
 
 
397 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.16 
 
 
474 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  34.15 
 
 
479 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.93 
 
 
479 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  37.02 
 
 
537 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 
509 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  32.1 
 
 
482 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.87 
 
 
396 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.8 
 
 
484 aa  170  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  32.3 
 
 
480 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
491 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.91 
 
 
478 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.89 
 
 
502 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 
509 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  32.51 
 
 
479 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.21 
 
 
395 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.4 
 
 
425 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.42 
 
 
419 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>