More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2081 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
475 aa  964    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  69.15 
 
 
462 aa  661    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  59.76 
 
 
480 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  45.66 
 
 
458 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.43 
 
 
445 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  40.55 
 
 
396 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  41.58 
 
 
396 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.96 
 
 
395 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.43 
 
 
395 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  40.49 
 
 
396 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  35.64 
 
 
483 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.29 
 
 
420 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.95 
 
 
425 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.6 
 
 
485 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.8 
 
 
392 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  35.29 
 
 
502 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  36.03 
 
 
420 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.65 
 
 
477 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.62 
 
 
478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  35 
 
 
502 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  34.64 
 
 
419 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.98 
 
 
420 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.36 
 
 
427 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.44 
 
 
541 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  32.68 
 
 
480 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.2 
 
 
374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  35.75 
 
 
479 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.12 
 
 
478 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  36 
 
 
479 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  36.46 
 
 
479 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  34.52 
 
 
436 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  35.73 
 
 
481 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  34.37 
 
 
478 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.59 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.47 
 
 
482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3607  phospholipase D/transphosphatidylase  36.72 
 
 
401 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000824683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  36.34 
 
 
478 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  34.93 
 
 
417 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.66 
 
 
492 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  32.7 
 
 
499 aa  216  9e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  35.36 
 
 
479 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.55 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.29 
 
 
483 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  34.46 
 
 
420 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  32.82 
 
 
446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  35.66 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  34.19 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  36.19 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.66 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  32.61 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  32.16 
 
 
514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  32.16 
 
 
514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  32.16 
 
 
514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  32.16 
 
 
514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  32.16 
 
 
514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
514 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  35.39 
 
 
479 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  38.71 
 
 
481 aa  213  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.59 
 
 
484 aa  212  9e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  34.82 
 
 
479 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  31.89 
 
 
514 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  32.58 
 
 
502 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.16 
 
 
472 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  35.11 
 
 
485 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.22 
 
 
478 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  34.82 
 
 
479 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  36.22 
 
 
478 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.85 
 
 
490 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  34.82 
 
 
417 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  35.38 
 
 
427 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.75 
 
 
478 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  35.98 
 
 
486 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  35.75 
 
 
476 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  34.36 
 
 
479 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.51 
 
 
479 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  31.89 
 
 
514 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  34.45 
 
 
474 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.69 
 
 
481 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  35.57 
 
 
476 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.88 
 
 
413 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  33.16 
 
 
494 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  33.16 
 
 
494 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.42 
 
 
464 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  32.17 
 
 
481 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  33.16 
 
 
412 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 
478 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.95 
 
 
483 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  35.48 
 
 
514 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.91 
 
 
464 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  35.62 
 
 
486 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  31.32 
 
 
488 aa  203  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  34.46 
 
 
479 aa  203  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.59 
 
 
470 aa  203  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 
479 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>