More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2046 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
420 aa  848    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.91 
 
 
462 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  35.38 
 
 
480 aa  222  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  34.2 
 
 
458 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.38 
 
 
445 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  38.21 
 
 
396 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  37.4 
 
 
396 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  37.33 
 
 
396 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  35.98 
 
 
475 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.41 
 
 
477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.55 
 
 
477 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  33.42 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  33.25 
 
 
480 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  31.78 
 
 
420 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.07 
 
 
483 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.6 
 
 
502 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.66 
 
 
395 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.87 
 
 
420 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  35.08 
 
 
385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.51 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  34.25 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.55 
 
 
395 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.63 
 
 
392 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  30.62 
 
 
420 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.2 
 
 
392 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  33.77 
 
 
446 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.83 
 
 
432 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  34.41 
 
 
479 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  35.69 
 
 
417 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.5 
 
 
374 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  30.95 
 
 
483 aa  186  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.8 
 
 
479 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  33.85 
 
 
481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  35.28 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.51 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.59 
 
 
489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  34.07 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.2 
 
 
490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  31.55 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  33.7 
 
 
478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 
419 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  34.17 
 
 
385 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.96 
 
 
474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.98 
 
 
385 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  34.28 
 
 
410 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.6 
 
 
464 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  31.44 
 
 
396 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.5 
 
 
479 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  32.21 
 
 
502 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  34.44 
 
 
422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.87 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  33.16 
 
 
413 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  34.26 
 
 
359 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  33.06 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  32.61 
 
 
476 aa  179  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.16 
 
 
474 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  32.6 
 
 
385 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  32.88 
 
 
476 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.71 
 
 
476 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  31.33 
 
 
413 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  32.98 
 
 
383 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  32.41 
 
 
417 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  34.48 
 
 
476 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.11 
 
 
492 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  35.75 
 
 
442 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.71 
 
 
483 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.03 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  31.84 
 
 
490 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 
427 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  30.16 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.33 
 
 
482 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  34.68 
 
 
479 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  35.93 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.29 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  32.5 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  31.01 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  34.12 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  34.12 
 
 
413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  34.12 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  34.12 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  34.12 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  29.09 
 
 
484 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  36.76 
 
 
478 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 
413 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  34.63 
 
 
491 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 
478 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  32.37 
 
 
370 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  34.18 
 
 
426 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.89 
 
 
509 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  34.81 
 
 
486 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  35.87 
 
 
422 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.89 
 
 
487 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  32.71 
 
 
372 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  28.41 
 
 
514 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  34.07 
 
 
490 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  34.51 
 
 
403 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  28.41 
 
 
514 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  35.61 
 
 
422 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  28.41 
 
 
514 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>