More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0557 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  100 
 
 
514 aa  1024    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  54.81 
 
 
537 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1712  phospholipase D/transphosphatidylase  50.21 
 
 
545 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0679  phospholipase D/transphosphatidylase  44.4 
 
 
466 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  37.47 
 
 
462 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  36.16 
 
 
396 aa  223  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  37.74 
 
 
396 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  36.89 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.34 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  36.07 
 
 
458 aa  213  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.2 
 
 
395 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  37.57 
 
 
480 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.66 
 
 
395 aa  203  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  31.04 
 
 
483 aa  189  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  35.48 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.52 
 
 
413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.06 
 
 
483 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  33.06 
 
 
483 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.41 
 
 
392 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  30.03 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.75 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.05 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  33.6 
 
 
481 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.09 
 
 
463 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 
420 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.5 
 
 
477 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  30.14 
 
 
509 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  33.5 
 
 
479 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  33.07 
 
 
486 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  35.73 
 
 
412 aa  171  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.83 
 
 
425 aa  170  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  32.36 
 
 
410 aa  169  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.5 
 
 
484 aa  169  9e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.72 
 
 
479 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.75 
 
 
509 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.19 
 
 
509 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.19 
 
 
509 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.46 
 
 
509 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.39 
 
 
514 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.75 
 
 
509 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  32.53 
 
 
490 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.19 
 
 
509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.95 
 
 
514 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.19 
 
 
509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 
514 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 
514 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 
514 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 
514 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  32.28 
 
 
491 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 
514 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  31.37 
 
 
484 aa  167  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  32.6 
 
 
479 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.25 
 
 
492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.84 
 
 
481 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  34.42 
 
 
403 aa  166  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  31.55 
 
 
420 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31.25 
 
 
499 aa  166  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.88 
 
 
514 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  33.92 
 
 
417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.83 
 
 
514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  31.45 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.22 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  31.45 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  34.51 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.15 
 
 
420 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.18 
 
 
485 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.65 
 
 
427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.69 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.54 
 
 
502 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.42 
 
 
481 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.25 
 
 
479 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.19 
 
 
485 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.62 
 
 
474 aa  163  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 
478 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.03 
 
 
420 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.97 
 
 
478 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.16 
 
 
502 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.15 
 
 
479 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.91 
 
 
490 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  33.69 
 
 
489 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  29.97 
 
 
479 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  29.32 
 
 
441 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  32.2 
 
 
481 aa  161  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.04 
 
 
541 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  29.21 
 
 
494 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  29.21 
 
 
494 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3607  phospholipase D/transphosphatidylase  31.01 
 
 
401 aa  160  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000824683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  31.22 
 
 
406 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.83 
 
 
474 aa  160  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  28.72 
 
 
479 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3316  phospholipase D/transphosphatidylase  32.04 
 
 
451 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  30.96 
 
 
479 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>