More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1740 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  98.65 
 
 		 445 aa  908    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  100 
 
 		 458 aa  946    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  44.87 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  47.3 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  45.66 
 
 		 475 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  40.06 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  39.67 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  36.34 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  39.5 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.5 
 
 		 395 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.95 
 
 		 395 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.78 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  32.81 
 
 		 477 aa  226  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  34.82 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  32.21 
 
 		 480 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.32 
 
 		 478 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.2 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.23 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.84 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.25 
 
 		 425 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  34.74 
 
 		 436 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  35.19 
 
 		 420 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.24 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  32.72 
 
 		 502 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.93 
 
 		 481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.56 
 
 		 482 aa  213  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  36.19 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  36.61 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  33.87 
 
 		 537 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  30.44 
 
 		 478 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  30.41 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.16 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.21 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.22 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  31.94 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.94 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  34.08 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.8 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.53 
 
 		 479 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.62 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  32.24 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.59 
 
 		 483 aa  204  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.71 
 
 		 479 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  31.06 
 
 		 491 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  32.72 
 
 		 490 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 		 483 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  31.39 
 
 		 514 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.34 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0679  phospholipase D/transphosphatidylase  35.39 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  34.25 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  35.11 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  31.55 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 		 479 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  29.93 
 
 		 480 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.89 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.16 
 
 		 484 aa  199  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  33.17 
 
 		 484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.21 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  31.75 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  33.24 
 
 		 417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.47 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  32.8 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  32.43 
 
 		 487 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  32.8 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.39 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  30.94 
 
 		 502 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  30.81 
 
 		 483 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.61 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.63 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  30.77 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.53 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.25 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.94 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  31.68 
 
 		 484 aa  194  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1712  phospholipase D/transphosphatidylase  35.14 
 
 		 545 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  29.24 
 
 		 473 aa  193  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  31.66 
 
 		 476 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.89 
 
 		 432 aa  193  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.42 
 
 		 474 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.94 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  31.73 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>