More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4073 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
446 aa  923    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  46.28 
 
 
419 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  47.8 
 
 
427 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.2 
 
 
425 aa  342  8e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  45.34 
 
 
420 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.78 
 
 
420 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  44.56 
 
 
420 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.66 
 
 
427 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  38.86 
 
 
436 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.24 
 
 
462 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.46 
 
 
477 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.18 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  32.18 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.26 
 
 
492 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
509 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
509 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  32.37 
 
 
509 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.41 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.84 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  34.32 
 
 
480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  32.87 
 
 
483 aa  213  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
502 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  36.29 
 
 
474 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.63 
 
 
478 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  36.69 
 
 
478 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  31.93 
 
 
488 aa  209  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  31.96 
 
 
481 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  35.52 
 
 
502 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.87 
 
 
485 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.26 
 
 
396 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.7 
 
 
484 aa  207  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.54 
 
 
489 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  34.2 
 
 
479 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  34.2 
 
 
481 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  34.57 
 
 
502 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  35.05 
 
 
514 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.09 
 
 
445 aa  206  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.04 
 
 
478 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  30.49 
 
 
441 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  34.74 
 
 
514 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  34.74 
 
 
514 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  34.74 
 
 
514 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  37.97 
 
 
406 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  34.74 
 
 
514 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  34.74 
 
 
514 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  34.74 
 
 
514 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.56 
 
 
482 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  33.69 
 
 
474 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  33.91 
 
 
479 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  35.05 
 
 
514 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  34.83 
 
 
514 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  34.74 
 
 
514 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  35.47 
 
 
484 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.68 
 
 
478 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  34.29 
 
 
479 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.31 
 
 
483 aa  202  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.6 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  34.74 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  35.47 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.36 
 
 
464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.55 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.72 
 
 
479 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.75 
 
 
474 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.41 
 
 
483 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  34.37 
 
 
439 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.14 
 
 
478 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  34.14 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.82 
 
 
474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.1 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  33.72 
 
 
479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  35.66 
 
 
477 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.64 
 
 
476 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  35.1 
 
 
481 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 
478 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.42 
 
 
374 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 
482 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  32.17 
 
 
477 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 
505 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 
505 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 
485 aa  192  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  30.52 
 
 
494 aa  192  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  30.52 
 
 
494 aa  192  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  35.44 
 
 
396 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  31.1 
 
 
479 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  32.17 
 
 
480 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  35.71 
 
 
396 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.87 
 
 
541 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
505 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  30.08 
 
 
476 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.14 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  35.96 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  31.1 
 
 
479 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.38 
 
 
479 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.4 
 
 
476 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  31.54 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  31.54 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>