More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2838 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
419 aa  850    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  55.58 
 
 
412 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  54.24 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  54.59 
 
 
417 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.44 
 
 
432 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.64 
 
 
453 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  52.56 
 
 
410 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  48.4 
 
 
406 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  49.11 
 
 
426 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  46.65 
 
 
422 aa  338  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  37.68 
 
 
417 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  33.88 
 
 
494 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  33.88 
 
 
494 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 
488 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  33.33 
 
 
487 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  30.1 
 
 
483 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  32.98 
 
 
499 aa  192  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.62 
 
 
476 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  31.08 
 
 
476 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  33.16 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.47 
 
 
374 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.89 
 
 
445 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.49 
 
 
474 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.44 
 
 
396 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.7 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.98 
 
 
472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  29.51 
 
 
490 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.02 
 
 
482 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.37 
 
 
485 aa  182  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.91 
 
 
478 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.38 
 
 
502 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 
502 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  32.46 
 
 
483 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
509 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.85 
 
 
541 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.87 
 
 
509 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
514 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
514 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
514 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
514 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
514 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
509 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  31.22 
 
 
505 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  31.22 
 
 
505 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.53 
 
 
509 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
514 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
514 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  31.25 
 
 
480 aa  176  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
514 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.53 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.16 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  29.78 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.72 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  32.28 
 
 
483 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  32.26 
 
 
490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.44 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  27.87 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.96 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.59 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.85 
 
 
508 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 
514 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  27.78 
 
 
483 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  30.42 
 
 
484 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.69 
 
 
477 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.01 
 
 
526 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  27.54 
 
 
483 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.48 
 
 
395 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  32.69 
 
 
478 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.6 
 
 
478 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.18 
 
 
479 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.05 
 
 
485 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  32.68 
 
 
372 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.12 
 
 
484 aa  169  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  33.15 
 
 
396 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  30.94 
 
 
420 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  33.59 
 
 
482 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.71 
 
 
495 aa  169  9e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  32.71 
 
 
477 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.91 
 
 
478 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  34.76 
 
 
537 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.83 
 
 
481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.2 
 
 
479 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.14 
 
 
472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  29.08 
 
 
490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.28 
 
 
478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.53 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  29.52 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  31.56 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2014  cardiolipin synthetase  29.13 
 
 
391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0180  putative cardiolipin synthetase  29.13 
 
 
391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  31.81 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.69 
 
 
395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  31.47 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.25 
 
 
478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  30.14 
 
 
479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>