More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3768 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 397 aa  803    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  55.35 
 
 		 384 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  46.58 
 
 		 383 aa  342  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  48.33 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  48.45 
 
 		 461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  47.03 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.29 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  46.25 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.12 
 
 		 422 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  39.7 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  38.13 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  42.08 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  41.22 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  38.32 
 
 		 413 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.71 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  39.61 
 
 		 451 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  45.18 
 
 		 401 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  45.95 
 
 		 401 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  38.19 
 
 		 413 aa  259  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  37.09 
 
 		 413 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  37.22 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  37.22 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  37.22 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  40.26 
 
 		 405 aa  259  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  37.22 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  37.94 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  38.07 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  37.94 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  38.07 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  37.94 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  37.94 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  36.93 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  37.82 
 
 		 413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  37.19 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  41.58 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  38.32 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  37.56 
 
 		 413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  40 
 
 		 403 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  39.53 
 
 		 416 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  42.61 
 
 		 439 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  36.68 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  39.39 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  38.7 
 
 		 413 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  39.62 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  36.72 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  41.04 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  40.64 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  40.15 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  37.28 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  34.62 
 
 		 460 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  37.43 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 424 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 424 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  35.56 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  37.38 
 
 		 424 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  37.13 
 
 		 424 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  37.38 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  37.32 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  36.76 
 
 		 426 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.32 
 
 		 419 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  36.1 
 
 		 416 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  39.56 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  40.27 
 
 		 437 aa  206  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  37.44 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  38.27 
 
 		 424 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  38.27 
 
 		 410 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  38.27 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  38.27 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  38.27 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  38.27 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  38.27 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  38.23 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.42 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.39 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  34.3 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.46 
 
 		 420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  35.87 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  34.01 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.01 
 
 		 445 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  36.46 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  34.33 
 
 		 385 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.81 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  33.88 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  34.69 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  33.07 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  32.98 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  34.46 
 
 		 370 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  33.16 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.98 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.51 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.6 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.65 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 406 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  34.17 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.72 
 
 		 478 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  33.16 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.94 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  32.65 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>