More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  96.51 
 
 
401 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  100 
 
 
401 aa  807    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  63.08 
 
 
400 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  64.01 
 
 
400 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  62.82 
 
 
400 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  62.56 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  64.08 
 
 
400 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  60.05 
 
 
416 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  59.38 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  55.78 
 
 
428 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  51.86 
 
 
413 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  53.35 
 
 
413 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  53.1 
 
 
413 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  51.86 
 
 
413 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  51.86 
 
 
413 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  53.35 
 
 
413 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  51.86 
 
 
413 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  53.73 
 
 
413 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  53.35 
 
 
413 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  53.1 
 
 
413 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  53.1 
 
 
413 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  53.35 
 
 
413 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  51.61 
 
 
413 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  53.1 
 
 
413 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  52.85 
 
 
413 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  54.43 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  54.26 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  54.43 
 
 
436 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  54.27 
 
 
433 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  52.78 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  53.73 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  53.33 
 
 
405 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  50.98 
 
 
422 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  56.2 
 
 
417 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  56.66 
 
 
363 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  54.73 
 
 
416 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  49.87 
 
 
413 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  47.14 
 
 
460 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  42.89 
 
 
397 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  41.85 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  43.28 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  43.27 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  39.18 
 
 
451 aa  229  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  42.51 
 
 
461 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  40.71 
 
 
442 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.95 
 
 
422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.9 
 
 
422 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  39.84 
 
 
411 aa  215  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.48 
 
 
384 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  41.64 
 
 
424 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  41.35 
 
 
424 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  41.35 
 
 
424 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  40.17 
 
 
424 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  39.63 
 
 
409 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  40.44 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.36 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  40.11 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  40.18 
 
 
424 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  40.46 
 
 
426 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  40.18 
 
 
424 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  39.89 
 
 
437 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  35.77 
 
 
396 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  39.89 
 
 
419 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.41 
 
 
419 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  40.64 
 
 
424 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  38.01 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  40.99 
 
 
424 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  40.99 
 
 
424 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  40.99 
 
 
424 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  40.99 
 
 
410 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  40.17 
 
 
424 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  40.99 
 
 
424 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  40.99 
 
 
424 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  37.07 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  35.24 
 
 
396 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  40.99 
 
 
424 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.32 
 
 
474 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.04 
 
 
485 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  36.09 
 
 
477 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  39.59 
 
 
481 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.38 
 
 
374 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  36.98 
 
 
477 aa  176  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  35.21 
 
 
486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.67 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  34.58 
 
 
480 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  39.05 
 
 
422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.71 
 
 
425 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  34.65 
 
 
486 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  36.69 
 
 
386 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  37.88 
 
 
392 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  37.84 
 
 
382 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  35 
 
 
385 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.83 
 
 
474 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  34.57 
 
 
486 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.18 
 
 
478 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  35.88 
 
 
385 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.96 
 
 
395 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  32.7 
 
 
385 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.96 
 
 
420 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.31 
 
 
490 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>