More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0807 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  99.02 
 
 
409 aa  808    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
409 aa  816    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  73.57 
 
 
410 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  74.69 
 
 
422 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  59.56 
 
 
411 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  61.22 
 
 
439 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  58.84 
 
 
414 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  48.1 
 
 
461 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  44.95 
 
 
383 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  48 
 
 
422 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  48 
 
 
422 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  46.75 
 
 
422 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  46.19 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  43.48 
 
 
396 aa  275  9e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  42.33 
 
 
426 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.64 
 
 
419 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  42.68 
 
 
424 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  41.12 
 
 
397 aa  246  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  42.89 
 
 
419 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  40.82 
 
 
451 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  42.25 
 
 
424 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  42.22 
 
 
424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  41.71 
 
 
424 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  41.44 
 
 
424 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  41.75 
 
 
424 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  41.75 
 
 
424 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.27 
 
 
384 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  37.12 
 
 
413 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  39.51 
 
 
428 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  45.33 
 
 
437 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  41.69 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  41.54 
 
 
424 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  41.54 
 
 
424 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  41.69 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  41.69 
 
 
424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  41.69 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  41.69 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  41.69 
 
 
424 aa  212  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 
413 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 
413 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 
413 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 
413 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  36.32 
 
 
413 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  41.64 
 
 
401 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  37.15 
 
 
413 aa  207  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  37.15 
 
 
413 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  36.9 
 
 
413 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  36.9 
 
 
413 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  40.51 
 
 
401 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  36.64 
 
 
413 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  36.64 
 
 
413 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  36.79 
 
 
400 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  38.5 
 
 
400 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  36.39 
 
 
413 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  36.39 
 
 
413 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  36.39 
 
 
413 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  40.16 
 
 
403 aa  202  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  39.89 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  36.53 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  36.08 
 
 
400 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  39.1 
 
 
433 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  38.1 
 
 
417 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  36.92 
 
 
401 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  36.27 
 
 
400 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  39.74 
 
 
436 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  39.3 
 
 
413 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  39.13 
 
 
416 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  38.84 
 
 
422 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  36.1 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  36.08 
 
 
460 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  33.59 
 
 
416 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  38.55 
 
 
363 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  38.56 
 
 
416 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  33.68 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
485 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.21 
 
 
425 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  29.95 
 
 
462 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  31.75 
 
 
406 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  33.25 
 
 
482 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  30.1 
 
 
396 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.8 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  32.39 
 
 
419 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.49 
 
 
392 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  27.88 
 
 
532 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  30.37 
 
 
486 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  27.98 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  28.09 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.67 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.82 
 
 
485 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  27.62 
 
 
502 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.84 
 
 
392 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  31.07 
 
 
385 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  29.92 
 
 
486 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  27.6 
 
 
485 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.21 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  25.86 
 
 
417 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  30 
 
 
410 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  29.66 
 
 
486 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.64 
 
 
478 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  30.15 
 
 
385 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>