More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0345 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  82.94 
 
 		 422 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 422 aa  839    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  92.65 
 
 		 422 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  61.76 
 
 		 442 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  62.25 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  46.55 
 
 		 411 aa  323  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  46.77 
 
 		 383 aa  322  6e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  47.76 
 
 		 439 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  47.25 
 
 		 409 aa  309  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.25 
 
 		 409 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  47.55 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  47.2 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  46.5 
 
 		 410 aa  290  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  46.12 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  45.63 
 
 		 422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  41.61 
 
 		 451 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  42.37 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.5 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  39.3 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  44.47 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  44.47 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  37.71 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  37.71 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  44.05 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  37.71 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  37.71 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  37.71 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  43.98 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  44.05 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.86 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  43.69 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  43.47 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  42.35 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  41.4 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  38.27 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  38.27 
 
 		 413 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  38.27 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  38.26 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  38.27 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  43.58 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  43.58 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  38.27 
 
 		 413 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  38.27 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  38.27 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  43.58 
 
 		 424 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  43.58 
 
 		 424 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  43.58 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  43.58 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  39.28 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  43.58 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  38.02 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  37.29 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  39.9 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  42.09 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  38.26 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  41.11 
 
 		 401 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  44.39 
 
 		 424 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  40.84 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  38.26 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  38.68 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  40.63 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  46.2 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  40.05 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  38.46 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  36.86 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  39 
 
 		 422 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  38.68 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  40.56 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  38.42 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  36.3 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  38.26 
 
 		 433 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  39.44 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  40 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  38.54 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.79 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  33.07 
 
 		 396 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  33.85 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  33.24 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  34.83 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  33.16 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  33.78 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.71 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.72 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.73 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.57 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.37 
 
 		 483 aa  152  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  31.88 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  34.97 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.78 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  31.23 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  32.18 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  32.8 
 
 		 474 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  34.41 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21690  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  30.99 
 
 		 422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  31.58 
 
 		 489 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  33.16 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  29.46 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  32.17 
 
 		 514 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>