More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1296 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 385 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  78.65 
 
 		 385 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  77.86 
 
 		 385 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  77.6 
 
 		 385 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  78.12 
 
 		 385 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  76.1 
 
 		 385 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  76.1 
 
 		 385 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  67.97 
 
 		 382 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  65.62 
 
 		 385 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  62.92 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  65.64 
 
 		 359 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.81 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  47.76 
 
 		 392 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  47.67 
 
 		 370 aa  311  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  33.51 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  34.41 
 
 		 420 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.7 
 
 		 420 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  33.69 
 
 		 474 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.56 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.55 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.04 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.92 
 
 		 485 aa  182  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.04 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.88 
 
 		 478 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  32.68 
 
 		 446 aa  179  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  31.34 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  32.7 
 
 		 478 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  33.53 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  32.18 
 
 		 479 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  32.68 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  33.59 
 
 		 451 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.34 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  30.89 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.06 
 
 		 396 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 483 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  35.29 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.23 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  33.51 
 
 		 416 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  32.15 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  32.31 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.06 
 
 		 502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.87 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  34.36 
 
 		 413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  32.18 
 
 		 479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  34.36 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  34.36 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  34.36 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  34.36 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  31.44 
 
 		 479 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  32.73 
 
 		 383 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.07 
 
 		 479 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  31.59 
 
 		 514 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.99 
 
 		 490 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  34.81 
 
 		 401 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.52 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  31.99 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  33.6 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.15 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  30.81 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.17 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  32.61 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  32.61 
 
 		 479 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.59 
 
 		 514 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.06 
 
 		 479 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  30.46 
 
 		 509 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  33.81 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  35.87 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  31.9 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2014  cardiolipin synthetase  29.29 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0180  putative cardiolipin synthetase  29.29 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  31.44 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  31.44 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3435  phospholipase D/transphosphatidylase  31.28 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  29.01 
 
 		 490 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 489 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  32.73 
 
 		 424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  32.99 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  31.18 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  32.73 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.38 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  32.73 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.27 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.54 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  29.22 
 
 		 505 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>