More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2641 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 424 aa  862    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  80.9 
 
 		 424 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  88.44 
 
 		 424 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  80.9 
 
 		 424 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  80.9 
 
 		 424 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  94.58 
 
 		 424 aa  828    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  92.22 
 
 		 424 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  79.95 
 
 		 424 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  94.34 
 
 		 424 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  80.9 
 
 		 424 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  80.9 
 
 		 424 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  98.35 
 
 		 424 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  94.34 
 
 		 424 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  80.9 
 
 		 424 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  81.22 
 
 		 410 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  63.55 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  65.48 
 
 		 419 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  64.05 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  43.64 
 
 		 461 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  42.68 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  42.2 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  43.32 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  43.9 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  37.71 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  43 
 
 		 442 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  42.36 
 
 		 409 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.36 
 
 		 409 aa  239  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  41.77 
 
 		 422 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.65 
 
 		 422 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  37.34 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.97 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  38.24 
 
 		 400 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  39.47 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  36.14 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  37.38 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  39.28 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.99 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  35.7 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  35.7 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  35.7 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  35.7 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  35.7 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  40.12 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  37.12 
 
 		 413 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  39.15 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  36.22 
 
 		 413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  39.26 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  37.27 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  37.01 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  37.01 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  37.01 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  37.01 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  40.18 
 
 		 401 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  37.01 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  36.75 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  37.01 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  38.6 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  37.71 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  39.6 
 
 		 401 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  37.71 
 
 		 417 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  41.43 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  35.44 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  39.55 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  38.7 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  36.11 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  37.78 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  36.05 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  37.29 
 
 		 400 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  36.24 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  37.81 
 
 		 401 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  33.59 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  32.99 
 
 		 385 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  32.22 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  34.27 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  39.77 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  34.53 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  32.48 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  32.48 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  35.56 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.53 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  34.53 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  38.81 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  31.97 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  39.43 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  31.96 
 
 		 487 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  35 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.17 
 
 		 487 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  31.08 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  32.83 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  31.88 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.13 
 
 		 509 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.13 
 
 		 509 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.96 
 
 		 483 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.13 
 
 		 509 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.13 
 
 		 509 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.81 
 
 		 392 aa  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.63 
 
 		 486 aa  152  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.76 
 
 		 484 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>