More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4349 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  100 
 
 		 385 aa  783    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  94.55 
 
 		 385 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  76.1 
 
 		 385 aa  614  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  73.51 
 
 		 385 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  72.21 
 
 		 385 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  72.73 
 
 		 385 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  72.73 
 
 		 385 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  67.62 
 
 		 382 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  63.02 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  61.52 
 
 		 386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  63.41 
 
 		 359 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  46.92 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  46.88 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.72 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  36.74 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  31.81 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  31.81 
 
 		 420 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.27 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  31.27 
 
 		 474 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  33.52 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.62 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  28.3 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  31.86 
 
 		 514 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 		 514 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  31.58 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.44 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  34.75 
 
 		 479 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  30.85 
 
 		 514 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.82 
 
 		 509 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  27.76 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  34.45 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 		 481 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.29 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.18 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.02 
 
 		 509 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.02 
 
 		 509 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.59 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.18 
 
 		 526 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.76 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  33.73 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.76 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  29.63 
 
 		 485 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.91 
 
 		 509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.29 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  34.46 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.23 
 
 		 502 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.71 
 
 		 502 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.84 
 
 		 485 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  34.04 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  34.04 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  34.04 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  34.04 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  34.04 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  32.28 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.78 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  32.2 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  33.69 
 
 		 413 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  28.23 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.39 
 
 		 479 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  33.07 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  32.72 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  33.7 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  33.15 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  32.89 
 
 		 490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  33.79 
 
 		 489 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0180  putative cardiolipin synthetase  29.24 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2014  cardiolipin synthetase  29.24 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.16 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  31.91 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  32.63 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  29.4 
 
 		 505 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  29.4 
 
 		 505 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  32.63 
 
 		 491 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  30.97 
 
 		 479 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.28 
 
 		 483 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  31 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  31 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  33.99 
 
 		 486 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  31.44 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.35 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.65 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.72 
 
 		 483 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  32.77 
 
 		 481 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  32.17 
 
 		 505 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  33.03 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  31.87 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.19 
 
 		 478 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  30.56 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  32.66 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>