More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3277 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  91.83 
 
 		 416 aa  774    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 416 aa  858    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  60.15 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  58.81 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  58.88 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  59.48 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  59.14 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  59.16 
 
 		 401 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  60.05 
 
 		 401 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  52.19 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  50.39 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  50.39 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  50.39 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  50.39 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  50.13 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  51.68 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  49.49 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  50.65 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  50.65 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  50.97 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  50.13 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  50.39 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  51.05 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  50.13 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  50.39 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  49.49 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  50.13 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  50.88 
 
 		 433 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  50.52 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  46.76 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  48.56 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  49.88 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  49.87 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  46.87 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  51 
 
 		 363 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  50.51 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  45.64 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  45.16 
 
 		 417 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  37.32 
 
 		 396 aa  223  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  36.36 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  35.56 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  36.02 
 
 		 451 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  37.18 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  35.81 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.34 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  34.78 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.33 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.34 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  34.89 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  35.54 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  34.85 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  36.24 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  36.84 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  36.26 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  36.28 
 
 		 481 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  36.26 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  36.26 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  36.06 
 
 		 481 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  35.19 
 
 		 479 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  34.86 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  35.76 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  35.67 
 
 		 479 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  35.06 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  33.97 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  33.42 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  35.47 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  35.37 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.91 
 
 		 409 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  35.77 
 
 		 410 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  33.23 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  35.38 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  31.44 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  32.3 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.85 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  31.18 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.89 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.38 
 
 		 392 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  35.78 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  32.54 
 
 		 385 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.26 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  33.13 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  31.18 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  36.55 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  36.55 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  36.55 
 
 		 424 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  36.55 
 
 		 424 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.62 
 
 		 385 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  33.62 
 
 		 392 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  36.55 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  36.55 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  34.51 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.23 
 
 		 478 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.06 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  36.26 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.88 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  35.67 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  32.44 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.64 
 
 		 483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.68 
 
 		 483 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>