More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0271 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  100 
 
 		 392 aa  791    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.23 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  47.76 
 
 		 385 aa  325  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  48.91 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  47.53 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  46.23 
 
 		 385 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  47.45 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  45.71 
 
 		 385 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  45.71 
 
 		 385 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  47.43 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  46.88 
 
 		 385 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  46.32 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  47.97 
 
 		 382 aa  298  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  44.93 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  33.43 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.05 
 
 		 419 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.94 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.58 
 
 		 474 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  37.88 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  37.1 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  34.23 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  34.58 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  34.39 
 
 		 480 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.89 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  36.97 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.58 
 
 		 479 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  31.28 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  35.4 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  33.53 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  33.53 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  33.53 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  33.53 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  35.37 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.76 
 
 		 479 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  32.76 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.48 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.76 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  32.76 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  33.01 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  31.31 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  32.47 
 
 		 490 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 		 483 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  31.32 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.83 
 
 		 514 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  34.73 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  35.83 
 
 		 476 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  32.76 
 
 		 479 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  32.76 
 
 		 479 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  34.52 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.68 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  35.44 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 		 514 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.83 
 
 		 476 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.43 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  35.18 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  33.62 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.1 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  35.12 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  30.46 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.86 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  32.19 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  30.46 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  30.46 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  33.43 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.32 
 
 		 479 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.26 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  30.19 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.88 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.83 
 
 		 514 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0679  phospholipase D/transphosphatidylase  36.71 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.55 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  30.19 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  30.19 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  31.23 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  30.19 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  31.71 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  31.23 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  31.55 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  31.55 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  31.55 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  31.55 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  31.55 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.92 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>