More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0911 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 439 aa  885    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  76.5 
 
 		 414 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  60.24 
 
 		 411 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  63.11 
 
 		 410 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  60 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  59.51 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  62.38 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  47.77 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  49 
 
 		 422 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.51 
 
 		 422 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  45.05 
 
 		 442 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  43.28 
 
 		 383 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.77 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  45.48 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  44.12 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  43.63 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  42.58 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  43.2 
 
 		 426 aa  276  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  41.95 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  41.95 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  42.2 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  41.71 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  41.95 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  43.45 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.69 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  43.24 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  43.24 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  43.24 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  43.24 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  43.24 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  43.9 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  43.24 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  43.24 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  42.61 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.44 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  44.33 
 
 		 437 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  39.35 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  34.46 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  38.85 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  35.73 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  35.73 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  35.73 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  35.73 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  35.73 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  40.56 
 
 		 401 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  39.19 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  39.57 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  39.73 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  36.47 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  34.77 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  34.53 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  34.53 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  34.53 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  39.55 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  34.29 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  38.42 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  34.53 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  37.56 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  34.29 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  34.29 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  34.05 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  40.88 
 
 		 433 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  33.75 
 
 		 401 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  37.19 
 
 		 436 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  38.04 
 
 		 400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  37.23 
 
 		 400 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  35.7 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  38.44 
 
 		 422 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  39.95 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  35.53 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  39.76 
 
 		 363 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  36.8 
 
 		 416 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  34.51 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.59 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  34.95 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.19 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  30.35 
 
 		 406 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.14 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.71 
 
 		 392 aa  153  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  30.52 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  32.83 
 
 		 385 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.2 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  33.08 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  31.76 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.65 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 		 486 aa  146  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  32.69 
 
 		 486 aa  146  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.05 
 
 		 425 aa  146  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  31.6 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.79 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  32.42 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  31.89 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  33.5 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  30.61 
 
 		 386 aa  143  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  31.55 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  32.35 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  31.23 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  28.06 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>