More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0278 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0455  phospholipase D/Transphosphatidylase  99.73 
 
 
389 aa  733    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0278  phospholipase D family protein  100 
 
 
366 aa  735    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  33.7 
 
 
385 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  34.8 
 
 
382 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.43 
 
 
385 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  34.43 
 
 
385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  35.01 
 
 
385 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  34.99 
 
 
359 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  34.34 
 
 
385 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.92 
 
 
392 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  33.52 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  33.43 
 
 
436 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  34.67 
 
 
370 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4349  phospholipase D family protein  32.98 
 
 
385 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4044  phospholipase D/transphosphatidylase  32.45 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185859  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  33.92 
 
 
502 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.67 
 
 
490 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  33.24 
 
 
502 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.41 
 
 
420 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  29.68 
 
 
420 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  32.02 
 
 
480 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
514 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.55 
 
 
514 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  28.65 
 
 
420 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.55 
 
 
514 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  34.22 
 
 
386 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
514 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  31.62 
 
 
479 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  32.01 
 
 
372 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  31.69 
 
 
481 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.5 
 
 
483 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  32.02 
 
 
490 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  31.6 
 
 
479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.34 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.75 
 
 
485 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.25 
 
 
445 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  31.29 
 
 
479 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  30.41 
 
 
397 aa  146  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.16 
 
 
425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
483 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  31.29 
 
 
406 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
479 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
479 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
479 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
479 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
479 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
479 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
479 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.06 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  29.29 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  28.99 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.07 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  30.31 
 
 
479 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.68 
 
 
482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 
426 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  29.97 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  29.76 
 
 
419 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.7 
 
 
419 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.53 
 
 
509 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.29 
 
 
474 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.53 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.83 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.12 
 
 
478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
481 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
479 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  33.15 
 
 
419 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.01 
 
 
483 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  31.45 
 
 
439 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  28.7 
 
 
479 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.26 
 
 
478 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.76 
 
 
526 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.27 
 
 
476 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.53 
 
 
509 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  30.09 
 
 
491 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  31.45 
 
 
518 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  30.88 
 
 
487 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.53 
 
 
509 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
478 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  28.12 
 
 
509 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.24 
 
 
509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  31.5 
 
 
483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  28.65 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
489 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 
479 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  27.67 
 
 
462 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  24.72 
 
 
470 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.24 
 
 
509 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.24 
 
 
509 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  31.14 
 
 
491 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  32.61 
 
 
505 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.12 
 
 
509 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  26.67 
 
 
476 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>