238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2008 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
504 aa  1031    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  47.54 
 
 
491 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  47.49 
 
 
512 aa  445  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  47.12 
 
 
525 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  46.09 
 
 
483 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.71 
 
 
502 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  45.03 
 
 
498 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  43.92 
 
 
502 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.49 
 
 
521 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.61 
 
 
498 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.49 
 
 
504 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  45.79 
 
 
483 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  37.75 
 
 
714 aa  332  9e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  40.71 
 
 
482 aa  329  8e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  41.65 
 
 
714 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  38.88 
 
 
735 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  39.61 
 
 
504 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  38.4 
 
 
714 aa  317  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.92 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.53 
 
 
701 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  37.2 
 
 
724 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  37.92 
 
 
732 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  37.95 
 
 
717 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  38.92 
 
 
478 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  37.71 
 
 
732 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  37.71 
 
 
732 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  37.39 
 
 
735 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 
518 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  35.01 
 
 
510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  36.73 
 
 
739 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  39.95 
 
 
746 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  36.65 
 
 
739 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  34.33 
 
 
803 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  34.01 
 
 
572 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.06 
 
 
503 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  37.77 
 
 
728 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  37.5 
 
 
728 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.42 
 
 
713 aa  261  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.48 
 
 
514 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  34.89 
 
 
517 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  32.21 
 
 
730 aa  243  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  38.21 
 
 
515 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  29.47 
 
 
720 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.27 
 
 
507 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.18 
 
 
513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.58 
 
 
517 aa  196  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.33 
 
 
507 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.67 
 
 
738 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  30.14 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  30.33 
 
 
533 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  29.34 
 
 
533 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  27.71 
 
 
512 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  23.3 
 
 
1522 aa  87.8  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  31.48 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  22.82 
 
 
1783 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  29.33 
 
 
524 aa  80.1  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.93 
 
 
546 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  26.21 
 
 
516 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  26.21 
 
 
516 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  26.21 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
754 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
734 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
754 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  24.87 
 
 
1821 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.63 
 
 
497 aa  66.6  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.77 
 
 
544 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  27.32 
 
 
537 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.56 
 
 
632 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.37 
 
 
486 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.19 
 
 
514 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.704033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  23.37 
 
 
681 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  27.41 
 
 
745 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  26.09 
 
 
473 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.23 
 
 
465 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.44 
 
 
536 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  22.17 
 
 
592 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  24 
 
 
436 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  25.47 
 
 
502 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  25.47 
 
 
502 aa  57.4  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  29.24 
 
 
668 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.76 
 
 
382 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  24.82 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  23.81 
 
 
480 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  24.06 
 
 
490 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.91 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  22.09 
 
 
511 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  23.44 
 
 
488 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.98 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1905  phospholipase D/transphosphatidylase  22.48 
 
 
394 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0345  cardiolipin synthetase  22.09 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  24.71 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  26.95 
 
 
482 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.06 
 
 
508 aa  53.9  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  24.73 
 
 
486 aa  53.9  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  22.59 
 
 
441 aa  53.5  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  25.61 
 
 
693 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  25.61 
 
 
693 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  22.84 
 
 
505 aa  53.5  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  22.84 
 
 
505 aa  53.5  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  26.17 
 
 
426 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>