233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31234 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  100 
 
 
174 aa  341  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  41.89 
 
 
264 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  40.91 
 
 
239 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  41.06 
 
 
250 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  40.4 
 
 
238 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  42.68 
 
 
225 aa  121  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  40.62 
 
 
242 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  37.75 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  37.75 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  42.38 
 
 
229 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  46.1 
 
 
149 aa  114  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  39.74 
 
 
242 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 
232 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  37.09 
 
 
232 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  35.76 
 
 
266 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 
232 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.1 
 
 
238 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  37.09 
 
 
207 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  37.78 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  34.56 
 
 
213 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  34.44 
 
 
220 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  35.12 
 
 
325 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  37.12 
 
 
206 aa  91.3  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  35.81 
 
 
623 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  39.32 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  34.78 
 
 
213 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  35.06 
 
 
229 aa  87.8  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  36.84 
 
 
199 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  37.07 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  37.61 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  36.76 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  35.21 
 
 
304 aa  85.1  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  33.77 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  33.77 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  37.59 
 
 
717 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  39.32 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35.43 
 
 
320 aa  81.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 
258 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  33.94 
 
 
252 aa  80.9  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.11 
 
 
722 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.64 
 
 
722 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 
713 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.03 
 
 
701 aa  77.4  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.25 
 
 
236 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.49 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  31.25 
 
 
236 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  30.56 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  31.94 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  30.56 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.27 
 
 
717 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  37.19 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  35.77 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  30.56 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  30.56 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  30.56 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  30.56 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  30.54 
 
 
714 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  34 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  33.82 
 
 
716 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  33.56 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  34.33 
 
 
238 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  35.46 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  34.92 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.56 
 
 
746 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 
722 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  33.85 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.56 
 
 
705 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  33.56 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  38.28 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.55 
 
 
229 aa  72  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.35 
 
 
716 aa  72  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  35.11 
 
 
738 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.06 
 
 
704 aa  71.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.88 
 
 
717 aa  71.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  34.33 
 
 
713 aa  71.2  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  34.75 
 
 
714 aa  70.9  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  32.82 
 
 
735 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  33.59 
 
 
239 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  35.88 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  33.86 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  35.88 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 
732 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  35.17 
 
 
732 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 
732 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  33.78 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1332  SNARE associated Golgi protein  39.17 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.61 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.85 
 
 
713 aa  69.3  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1430  SNARE associated Golgi protein  39.17 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.159298  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  33.59 
 
 
714 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  33.59 
 
 
714 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  38.28 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  29.87 
 
 
225 aa  67.8  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>