82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1333 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 236 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  32.51 
 
 		 714 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.29 
 
 		 701 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  31.22 
 
 		 738 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 724 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  32.96 
 
 		 717 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 732 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  34.29 
 
 		 732 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  34.29 
 
 		 732 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  32.67 
 
 		 735 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  29.44 
 
 		 735 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 		 746 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 		 714 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.5 
 
 		 713 aa  92  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  31.05 
 
 		 803 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  34.72 
 
 		 728 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  34.72 
 
 		 728 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  29.9 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  30.85 
 
 		 714 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  32.64 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  32.64 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  28.63 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  30.9 
 
 		 730 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.38 
 
 		 720 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  32.29 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  27.18 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  31.9 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  31.9 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  31.9 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  28.48 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  27.37 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.17 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  25.76 
 
 		 623 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.9 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  27.62 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  25.26 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  30.51 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  28.44 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  25.65 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  28.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  32.76 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 282 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2631  hypothetical protein  24.7 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  31.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 282 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  25.32 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  29.66 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  30.89 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  27.66 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  27.66 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  31.36 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  25.36 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  31.03 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  30.89 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  29.6 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 		 716 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  27.16 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  24.84 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  22.39 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  25.15 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  29.23 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  22.39 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.68 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  30.53 
 
 		 738 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  26.6 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  24.72 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1332  SNARE associated Golgi protein  39.06 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1430  SNARE associated Golgi protein  39.06 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.159298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  23.48 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  27.5 
 
 		 713 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  22.73 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 		 232 aa  42  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  32.76 
 
 		 235 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  23.98 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  35.25 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>