219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3135 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  65.99 
 
 
267 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  67.79 
 
 
245 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  55.41 
 
 
252 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.03 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.95 
 
 
229 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  42 
 
 
232 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  36.84 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  38.85 
 
 
239 aa  92  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  38.85 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  38.78 
 
 
229 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  36.81 
 
 
714 aa  85.5  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  30.86 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  37.14 
 
 
264 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  28.71 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  37.14 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.44 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  31.11 
 
 
223 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.61 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  35.33 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  37.16 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  32.94 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.23 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  34.27 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  31.03 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.87 
 
 
713 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  32.05 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  32.05 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  32.26 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  33.14 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  34.3 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 
717 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  28.84 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.11 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.21 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  30.11 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  37.58 
 
 
738 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  30.3 
 
 
735 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  32.48 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  30.73 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  32.64 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  32.04 
 
 
714 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  34.23 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  34.21 
 
 
717 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  33.58 
 
 
724 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 
732 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  34.81 
 
 
732 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  34.81 
 
 
732 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  32.84 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.65 
 
 
738 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.01 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  29.01 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  28.96 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  35.33 
 
 
716 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  31.11 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.75 
 
 
746 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  27.62 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  28.02 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  28.4 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  28.4 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.6 
 
 
722 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 
224 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  36.3 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  28.4 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 
237 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.87 
 
 
716 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  27.78 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.07 
 
 
225 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  32.97 
 
 
240 aa  62  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.16 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.15 
 
 
722 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  31.71 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  29.84 
 
 
194 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  35.76 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 
735 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  32.12 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.77 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.7 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  35.77 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  31.68 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  36.51 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  31.71 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  31.71 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  37.3 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  31.71 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  37.39 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  31.71 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  31.71 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>