177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2418 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 		 283 aa  550  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  49.55 
 
 		 229 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  48.02 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  45.27 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  41.45 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  41.45 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  41.45 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  42.29 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  40.76 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  35 
 
 		 229 aa  85.9  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  29.29 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  37.74 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  35.85 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  36.3 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  38.62 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  33.96 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  33.96 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.95 
 
 		 713 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  29.9 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.11 
 
 		 623 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  29.47 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.99 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  28.5 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  29.45 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  28.99 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  28.99 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  32.35 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  28.4 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.27 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 232 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  34.9 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.81 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  25.63 
 
 		 803 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  34.62 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.68 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.43 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  29.08 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  29.86 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  31.09 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.37 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  26.69 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  30.71 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  29.44 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  33.14 
 
 		 717 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 		 722 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  28.21 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  29.14 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.67 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  32.09 
 
 		 732 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  32.09 
 
 		 732 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  31.34 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  27.73 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  29.56 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  33.1 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  29.5 
 
 		 714 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.41 
 
 		 738 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.11 
 
 		 712 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  28.46 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.01 
 
 		 746 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  29.75 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  27.86 
 
 		 714 aa  55.8  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  31.85 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 746 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.7 
 
 		 720 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.17 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  33.76 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  31.09 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  27.06 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  26.92 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.22 
 
 		 722 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  29.27 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2421  hypothetical protein  31.68 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  26.83 
 
 		 738 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  28.74 
 
 		 730 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  26.14 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25.97 
 
 		 735 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  30.38 
 
 		 716 aa  52.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.52 
 
 		 224 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  31.94 
 
 		 185 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  26.67 
 
 		 235 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  28.17 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  31.39 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  25.68 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  30.71 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.08 
 
 		 717 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>