153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3057 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 226 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2421  hypothetical protein  73.45 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.21 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  33.12 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  30.98 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  30.67 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  32.39 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  24.66 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  29.45 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  33.59 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  30.41 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  33.11 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  29.91 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  32.11 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.39 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.97 
 
 		 623 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.16 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  29.21 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  26.77 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  31.15 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  31.71 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  30.97 
 
 		 714 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.25 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  26.9 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.77 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  26 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  26 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  35.9 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  31.37 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  30.83 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.66 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  30.71 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  30.71 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  31.79 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  33.57 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  33.57 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  26.89 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  31.21 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  31.21 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  31.21 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  30.32 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  26.78 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.57 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  24.86 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.21 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  31.21 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  31.49 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  31.87 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  31.15 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  30.5 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  25.29 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  30.08 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  25.44 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  28.86 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  27.92 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  29.27 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  29.92 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  29.27 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  27.43 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  26.72 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  32.54 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  28.72 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  28.72 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  28.72 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  25.35 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.35 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.77 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  25.35 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  32.4 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  26.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.79 
 
 		 713 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  25.35 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  25.35 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  25.35 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  25.35 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  29.25 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1711  hypothetical protein  28.28 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.427303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  23.87 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1878  hypothetical protein  26.45 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.826687  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  23.87 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  28.79 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  26.67 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.13 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04261  hypothetical protein  28.28 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  24.62 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0449  hypothetical protein  24.79 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0743874  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  31.13 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  31.07 
 
 		 803 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>