More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6502 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  97.68 
 
 		 732 aa  1380    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  84.19 
 
 		 739 aa  1155    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  72.7 
 
 		 728 aa  868    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  53.88 
 
 		 735 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 732 aa  1439    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  83.93 
 
 		 746 aa  1158    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  72.7 
 
 		 728 aa  868    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  84.19 
 
 		 739 aa  1155    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 732 aa  1439    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  49 
 
 		 735 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  45.1 
 
 		 714 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  42.84 
 
 		 714 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  42.33 
 
 		 717 aa  524  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  43.1 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  41.27 
 
 		 724 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.93 
 
 		 713 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.09 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  34.24 
 
 		 803 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.42 
 
 		 502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  40.16 
 
 		 518 aa  325  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  39.58 
 
 		 502 aa  324  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  44.23 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  39.96 
 
 		 525 aa  320  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.22 
 
 		 474 aa  319  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.87 
 
 		 521 aa  316  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  31.17 
 
 		 720 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  30.29 
 
 		 738 aa  312  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  38.81 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  38.81 
 
 		 498 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  40.34 
 
 		 491 aa  301  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  39.49 
 
 		 483 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  31.01 
 
 		 730 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.51 
 
 		 504 aa  296  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  37.23 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  40.18 
 
 		 504 aa  290  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  37.34 
 
 		 512 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  38.92 
 
 		 572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.08 
 
 		 498 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.87 
 
 		 503 aa  279  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  39.88 
 
 		 482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.21 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  38.07 
 
 		 517 aa  248  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  34.65 
 
 		 510 aa  227  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.53 
 
 		 507 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  40.75 
 
 		 515 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.29 
 
 		 517 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.98 
 
 		 507 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.14 
 
 		 513 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  40.4 
 
 		 252 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  34.36 
 
 		 232 aa  114  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29 
 
 		 470 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  38 
 
 		 246 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  42.75 
 
 		 240 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  42.65 
 
 		 239 aa  94  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.87 
 
 		 465 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  35.85 
 
 		 226 aa  90.9  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  25.56 
 
 		 512 aa  89.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  30.36 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  28.7 
 
 		 264 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 236 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.16 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  34.16 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.21 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  31.21 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.15 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  39.37 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.07 
 
 		 239 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.38 
 
 		 717 aa  77  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  36.67 
 
 		 245 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  35.2 
 
 		 220 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  36.07 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  21.86 
 
 		 1522 aa  76.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  42.02 
 
 		 225 aa  76.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  34.06 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  26.54 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  26.82 
 
 		 524 aa  73.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.85 
 
 		 236 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  29.32 
 
 		 242 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.85 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  37.29 
 
 		 282 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  29.85 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  37.04 
 
 		 232 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  31.64 
 
 		 252 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  29.85 
 
 		 236 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  37.29 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  29.1 
 
 		 236 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  29.85 
 
 		 192 aa  72.4  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.85 
 
 		 236 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.85 
 
 		 236 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  34.33 
 
 		 265 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  28.77 
 
 		 235 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.85 
 
 		 236 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.69 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  33.83 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>