More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1525 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  61.7 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  61.7 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  59.79 
 
 		 251 aa  241  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  63.02 
 
 		 237 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  61.36 
 
 		 239 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  55.68 
 
 		 235 aa  197  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  55.68 
 
 		 235 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  55.68 
 
 		 235 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  55.68 
 
 		 235 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  55.68 
 
 		 235 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  55.68 
 
 		 235 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  55.68 
 
 		 235 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  55.68 
 
 		 235 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  55.68 
 
 		 235 aa  195  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  49.66 
 
 		 252 aa  138  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  42.67 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  35.1 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 		 234 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 		 267 aa  91.3  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  35.03 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  36.81 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  27.33 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.87 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  31.61 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  40.74 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  38.14 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  31.32 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  31.32 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  26.53 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  26.29 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  30.26 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  27.43 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  27.81 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  35 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  26.55 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  32.35 
 
 		 717 aa  64.7  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  27.17 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.81 
 
 		 717 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  31.71 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  29.55 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.49 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  31.94 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  29.37 
 
 		 714 aa  62  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  29.84 
 
 		 255 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  29.84 
 
 		 255 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  29.84 
 
 		 255 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  34.4 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  28.78 
 
 		 320 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  30.28 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  34.81 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  28.95 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  27.78 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.23 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  29.66 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  28.95 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  33.11 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30.83 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  24.73 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  28.77 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  27.89 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  31.91 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3177  SNARE associated Golgi protein  32.52 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.66 
 
 		 722 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  28.72 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  25.73 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.69 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  26.7 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.1 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  25.33 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  29.56 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  32.88 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.61 
 
 		 713 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.13 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.57 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  29.59 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  32.53 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  27.08 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  29.66 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>