More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3732 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  100 
 
 		 720 aa  1482    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  62.8 
 
 		 738 aa  952    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  37.36 
 
 		 730 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  31.42 
 
 		 724 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  30.61 
 
 		 714 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  32.55 
 
 		 714 aa  343  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  31.1 
 
 		 735 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 		 717 aa  328  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.69 
 
 		 701 aa  320  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  31.01 
 
 		 714 aa  316  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  31.02 
 
 		 735 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 732 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  31.17 
 
 		 732 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  31.17 
 
 		 732 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  33.47 
 
 		 728 aa  302  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  33.43 
 
 		 728 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 746 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  31.02 
 
 		 739 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.08 
 
 		 713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  31.02 
 
 		 739 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  35.12 
 
 		 491 aa  253  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  27.9 
 
 		 803 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  36.21 
 
 		 478 aa  245  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  33.49 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  35.51 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.95 
 
 		 474 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.86 
 
 		 521 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.02 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  32.94 
 
 		 572 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 504 aa  221  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  31.7 
 
 		 483 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  31.7 
 
 		 498 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  31.4 
 
 		 502 aa  218  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.87 
 
 		 498 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  31.52 
 
 		 512 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  30.64 
 
 		 482 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.54 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  32.29 
 
 		 517 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.19 
 
 		 507 aa  207  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  31.64 
 
 		 483 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.9 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  29.47 
 
 		 504 aa  200  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.21 
 
 		 503 aa  187  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  36.07 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.32 
 
 		 513 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.78 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.65 
 
 		 517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  28.73 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  27.71 
 
 		 470 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  30.18 
 
 		 232 aa  102  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  26.89 
 
 		 533 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 734 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 754 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 754 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 		 1522 aa  89  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  26.18 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  30.93 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  30.43 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 		 228 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  25.89 
 
 		 516 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  25.89 
 
 		 516 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.79 
 
 		 544 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  28.74 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.39 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25.75 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.65 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.83 
 
 		 512 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  29.34 
 
 		 217 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  22.92 
 
 		 1783 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  29.14 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  29.34 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  28.36 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  32.04 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.21 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  25.99 
 
 		 592 aa  71.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  26.35 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  30.23 
 
 		 236 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  31.15 
 
 		 239 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  33.61 
 
 		 232 aa  69.7  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  26.49 
 
 		 225 aa  69.7  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  28.05 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  24.77 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.56 
 
 		 536 aa  67.8  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  24.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  24.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  24.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  24.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  24.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  24.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  24.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.14 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  26.71 
 
 		 485 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  24.49 
 
 		 235 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>