More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0043 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  93.23 
 
 
502 aa  954    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
502 aa  1014    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  53.7 
 
 
483 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  53.7 
 
 
498 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  52.28 
 
 
483 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.44 
 
 
521 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  50.54 
 
 
491 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.8 
 
 
504 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  47.99 
 
 
525 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  43.71 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  44.95 
 
 
512 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  43.34 
 
 
714 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.38 
 
 
498 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  40.7 
 
 
714 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  45.32 
 
 
482 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  43.39 
 
 
504 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  40.59 
 
 
717 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  40.21 
 
 
735 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  45.59 
 
 
714 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  40.42 
 
 
732 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  40.42 
 
 
732 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  40.42 
 
 
732 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  40.08 
 
 
739 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  39.87 
 
 
739 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  41.67 
 
 
518 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  42.42 
 
 
478 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.73 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.26 
 
 
701 aa  315  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  38.05 
 
 
724 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  37.53 
 
 
746 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  37.58 
 
 
510 aa  302  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  38.52 
 
 
735 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  37.16 
 
 
803 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  37.58 
 
 
517 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  37.16 
 
 
572 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.41 
 
 
503 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  38.43 
 
 
728 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  38 
 
 
728 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.4 
 
 
514 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.93 
 
 
713 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  40.76 
 
 
515 aa  263  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.93 
 
 
517 aa  259  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.34 
 
 
513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  30.53 
 
 
730 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.18 
 
 
507 aa  217  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.54 
 
 
720 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.62 
 
 
507 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.74 
 
 
738 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  27.25 
 
 
470 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.12 
 
 
533 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  27.46 
 
 
533 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.08 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  26.84 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.27 
 
 
546 aa  83.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  24 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  29.86 
 
 
472 aa  77  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  29.75 
 
 
754 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.75 
 
 
734 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  29.75 
 
 
754 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  24.15 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  25.64 
 
 
1821 aa  73.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.89 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
524 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  25.06 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.52 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  26.48 
 
 
509 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.19 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.15 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.62 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.15 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  27.15 
 
 
510 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  23.52 
 
 
1522 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  24.16 
 
 
509 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  25.25 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  25.25 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  26.8 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  26.67 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  30.63 
 
 
693 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  30.63 
 
 
693 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  23.49 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.79 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.39 
 
 
541 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  27.14 
 
 
396 aa  67  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.49 
 
 
632 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  26 
 
 
502 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  21.8 
 
 
1783 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  26.09 
 
 
509 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  25.93 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  24.22 
 
 
478 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1860  cardiolipin synthetase  25.79 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.38 
 
 
544 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 
693 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2123  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.59 
 
 
394 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  25.9 
 
 
486 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2155  cardiolipin synthetase domain protein  26.59 
 
 
394 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000221314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>