163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2624 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
544 aa  1121    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  30.16 
 
 
592 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  30.26 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  24.35 
 
 
510 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  26.84 
 
 
516 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  26.84 
 
 
516 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.33 
 
 
533 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.86 
 
 
533 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.42 
 
 
465 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.06 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.38 
 
 
546 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 
734 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 
754 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 
754 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  25.79 
 
 
720 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.19 
 
 
507 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.15 
 
 
507 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  26.89 
 
 
714 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  27.24 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  26.11 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25.63 
 
 
735 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  26.11 
 
 
491 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  25.85 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  22.55 
 
 
730 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  26.93 
 
 
714 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.57 
 
 
498 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.26 
 
 
504 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  24.41 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  27.01 
 
 
738 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.32 
 
 
701 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.38 
 
 
502 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  24.3 
 
 
504 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.22 
 
 
382 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  23.77 
 
 
504 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  25.16 
 
 
732 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  25.16 
 
 
732 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  24.32 
 
 
732 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  23.87 
 
 
498 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  23.67 
 
 
483 aa  64.7  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  26.73 
 
 
572 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  22.29 
 
 
517 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  23.26 
 
 
483 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  23.53 
 
 
525 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  23.94 
 
 
714 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  24.02 
 
 
502 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 
483 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  22.74 
 
 
483 aa  61.2  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  24.77 
 
 
803 aa  59.3  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1291  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.81 
 
 
509 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  24.57 
 
 
739 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 
420 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.22 
 
 
521 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.77 
 
 
536 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  26.63 
 
 
735 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  23.41 
 
 
494 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  23.41 
 
 
494 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  23.01 
 
 
512 aa  57  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  25.12 
 
 
484 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  24.66 
 
 
717 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  30.36 
 
 
482 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  23.74 
 
 
484 aa  55.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  24 
 
 
739 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.91 
 
 
453 aa  54.3  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.19 
 
 
513 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  29.19 
 
 
515 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.38 
 
 
677 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  23.3 
 
 
417 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  23.76 
 
 
410 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.05 
 
 
517 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  24.63 
 
 
746 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  22.78 
 
 
518 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  23.19 
 
 
724 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  24 
 
 
503 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.19 
 
 
395 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.52 
 
 
487 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  22.87 
 
 
417 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.87 
 
 
395 aa  51.6  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  22.18 
 
 
488 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  23.73 
 
 
413 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.91 
 
 
474 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.5 
 
 
477 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  21.1 
 
 
1522 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.48 
 
 
490 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.5 
 
 
486 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  34.94 
 
 
745 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  23.63 
 
 
478 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  30.46 
 
 
728 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.83 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  23.4 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  23.02 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  23.02 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.95 
 
 
508 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  21.56 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  24.81 
 
 
479 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  22.67 
 
 
477 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  30.67 
 
 
728 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  22.01 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  21.27 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  22.01 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  22.01 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>