122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67220 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  100 
 
 
745 aa  1534    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  33.84 
 
 
684 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  29.97 
 
 
655 aa  239  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  35.04 
 
 
668 aa  225  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  31.61 
 
 
652 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  28.16 
 
 
693 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  28.16 
 
 
693 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  27.32 
 
 
693 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  28.6 
 
 
684 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.5 
 
 
691 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  27.84 
 
 
681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  27.42 
 
 
676 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 
759 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  29.59 
 
 
516 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  29.59 
 
 
516 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  30.29 
 
 
714 aa  65.1  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.59 
 
 
510 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  32.75 
 
 
735 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  30.82 
 
 
479 aa  62  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  29.45 
 
 
479 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  26.6 
 
 
1821 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  40.24 
 
 
470 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 
498 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  27.55 
 
 
504 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  49.12 
 
 
512 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 
483 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.15 
 
 
734 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  29.15 
 
 
754 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  29.15 
 
 
754 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  29.56 
 
 
803 aa  59.3  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  26.11 
 
 
533 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  28.77 
 
 
479 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 
724 aa  58.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 
502 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  28.77 
 
 
481 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  28.77 
 
 
479 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.55 
 
 
504 aa  57.4  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  24.46 
 
 
1783 aa  57.4  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 
1522 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 
483 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  33.13 
 
 
714 aa  55.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.64 
 
 
521 aa  55.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  26.17 
 
 
490 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  26.84 
 
 
730 aa  53.9  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  41.46 
 
 
525 aa  53.9  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.34 
 
 
465 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  27.4 
 
 
479 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.4 
 
 
546 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  27.33 
 
 
537 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  28.1 
 
 
714 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.91 
 
 
498 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  25.5 
 
 
491 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  27.4 
 
 
481 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  27.37 
 
 
738 aa  53.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  26.71 
 
 
479 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  30.18 
 
 
739 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.28 
 
 
502 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 
572 aa  51.6  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  30.18 
 
 
739 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25.33 
 
 
533 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  24.83 
 
 
417 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  32.54 
 
 
518 aa  50.8  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  29.21 
 
 
510 aa  50.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.25 
 
 
544 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  27.98 
 
 
517 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 
717 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  26.03 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  25.93 
 
 
720 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
491 aa  50.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  31.65 
 
 
1219 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  24.66 
 
 
477 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  24.67 
 
 
481 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  26.8 
 
 
439 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  24.66 
 
 
477 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  24.14 
 
 
489 aa  48.5  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  31.74 
 
 
478 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  55.1 
 
 
801 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  46.81 
 
 
270 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  28.77 
 
 
518 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 
592 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3264  cardiolipin synthetase domain protein  31.17 
 
 
377 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.415257  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  27.32 
 
 
735 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  22.22 
 
 
833 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  23.97 
 
 
488 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  26.03 
 
 
509 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  26.03 
 
 
509 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  26.03 
 
 
509 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  42 
 
 
775 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  44.9 
 
 
818 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  26.03 
 
 
509 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 
512 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  58.97 
 
 
1103 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.56 
 
 
484 aa  46.6  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.67 
 
 
474 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  25.15 
 
 
492 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  26.32 
 
 
478 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  36.11 
 
 
482 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  26.17 
 
 
479 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  26.03 
 
 
509 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  25.34 
 
 
509 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>