More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4728 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 498 aa  1019    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  54.45 
 
 		 491 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  47.45 
 
 		 525 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  48.28 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  48.28 
 
 		 498 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  47.67 
 
 		 483 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  43.61 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.23 
 
 		 521 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.17 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.38 
 
 		 502 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  44.83 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  42.77 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  38.05 
 
 		 714 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  41.65 
 
 		 482 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  39.09 
 
 		 735 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  38.67 
 
 		 714 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  41.11 
 
 		 735 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  41.36 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  41.82 
 
 		 518 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  39.29 
 
 		 504 aa  316  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.36 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.09 
 
 		 701 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  40.7 
 
 		 724 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  38.61 
 
 		 717 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  39.04 
 
 		 572 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  38.49 
 
 		 732 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  37.53 
 
 		 732 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  37.53 
 
 		 732 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  37.45 
 
 		 739 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  37.53 
 
 		 739 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  38.92 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  37.63 
 
 		 746 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  36.97 
 
 		 730 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  35.64 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  39.33 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.03 
 
 		 713 aa  274  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.47 
 
 		 503 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  38.74 
 
 		 728 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.34 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  34.85 
 
 		 803 aa  263  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  38.53 
 
 		 728 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  38.95 
 
 		 515 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.55 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  33.87 
 
 		 720 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.96 
 
 		 517 aa  223  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.99 
 
 		 507 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  32.95 
 
 		 738 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.74 
 
 		 507 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29.8 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  30.42 
 
 		 516 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  30.42 
 
 		 516 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.01 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  31.33 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  27.19 
 
 		 533 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 		 1522 aa  100  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  31.49 
 
 		 533 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  24.11 
 
 		 1783 aa  91.3  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  30.38 
 
 		 734 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  30.38 
 
 		 754 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  30.38 
 
 		 754 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  28.79 
 
 		 512 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.69 
 
 		 632 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  31.06 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  25.98 
 
 		 1821 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.27 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.59 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.78 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  24.27 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  28.78 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  25.45 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  25.88 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  24.67 
 
 		 775 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  29.02 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.5 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  26 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  27.52 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  25.81 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  24.32 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  24.51 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.2 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  26.96 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  24.51 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.74 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.63 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.18 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.08 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  23.24 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  22.82 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.28 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  27.63 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  23.51 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  25.2 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  23.02 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  27.06 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  26.04 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  23.03 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  27.72 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  29.38 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  29.38 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>