More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0934 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
468 aa  964    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  38.82 
 
 
463 aa  348  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  37.04 
 
 
441 aa  332  8e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3471  phospholipase D/transphosphatidylase  33.19 
 
 
471 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169298  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3170  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.05 
 
 
458 aa  276  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  32.55 
 
 
482 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2886  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.48 
 
 
467 aa  256  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3563  cardiolipin synthetase 2  33.48 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.483916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.09 
 
 
459 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  33.57 
 
 
470 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.85 
 
 
509 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.83 
 
 
509 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  32.03 
 
 
509 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.83 
 
 
509 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.83 
 
 
509 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.83 
 
 
509 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.83 
 
 
509 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.98 
 
 
485 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.83 
 
 
509 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  31.97 
 
 
509 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  31.97 
 
 
509 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  32.92 
 
 
470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.68 
 
 
478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.04 
 
 
541 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  29.84 
 
 
483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 
477 aa  216  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  30.43 
 
 
491 aa  216  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  30.72 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.26 
 
 
483 aa  213  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.65 
 
 
502 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 
502 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  28.84 
 
 
492 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  31.13 
 
 
490 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 
514 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  28.38 
 
 
497 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 
514 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
514 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
514 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
514 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
514 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
514 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
514 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  29.74 
 
 
486 aa  209  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.96 
 
 
482 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 
485 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  28.28 
 
 
484 aa  208  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  30.72 
 
 
477 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
483 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.45 
 
 
514 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  29.77 
 
 
484 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 
514 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.02 
 
 
478 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  31.02 
 
 
514 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
483 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.74 
 
 
476 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  27.69 
 
 
499 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  28.87 
 
 
483 aa  205  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.27 
 
 
472 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  28.69 
 
 
532 aa  204  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  29.06 
 
 
490 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.74 
 
 
476 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  29.45 
 
 
478 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  31.19 
 
 
486 aa  203  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  29.48 
 
 
478 aa  203  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  30.27 
 
 
490 aa  203  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.54 
 
 
498 aa  202  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.82 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  28.33 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  28.25 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  28.04 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  28.75 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  29.52 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.52 
 
 
474 aa  200  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  29.02 
 
 
476 aa  200  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.66 
 
 
476 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.5 
 
 
490 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  29.4 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.44 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  28.67 
 
 
486 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  28.67 
 
 
486 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  28.67 
 
 
486 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  28.45 
 
 
479 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  29.11 
 
 
483 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  28.93 
 
 
486 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  29.12 
 
 
477 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  29.81 
 
 
485 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  28.51 
 
 
486 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  29.17 
 
 
484 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  28.03 
 
 
479 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.25 
 
 
481 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.36 
 
 
474 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  29.69 
 
 
505 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>