More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3962 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  100 
 
 
470 aa  930    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2886  phospholipase D/Transphosphatidylase  68.83 
 
 
467 aa  608  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3563  cardiolipin synthetase 2  68.83 
 
 
467 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.483916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3471  phospholipase D/transphosphatidylase  47.77 
 
 
471 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169298  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.36 
 
 
459 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3170  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.29 
 
 
458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  33.82 
 
 
468 aa  252  9.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 
441 aa  250  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  36.2 
 
 
482 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  32.76 
 
 
463 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  33.63 
 
 
491 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.76 
 
 
472 aa  210  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.19 
 
 
474 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  34.25 
 
 
479 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  33.18 
 
 
490 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.78 
 
 
481 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.5 
 
 
479 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.16 
 
 
486 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.45 
 
 
474 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.58 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  30.7 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.54 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.51 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  37.33 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 
484 aa  202  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  32.64 
 
 
472 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  33.69 
 
 
484 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.68 
 
 
479 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.62 
 
 
479 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  26.69 
 
 
509 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  26.64 
 
 
509 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.77 
 
 
374 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  30.8 
 
 
479 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  33.48 
 
 
482 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.11 
 
 
481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  33.72 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  26.43 
 
 
509 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.39 
 
 
486 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  33.63 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.68 
 
 
491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  26.43 
 
 
509 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.36 
 
 
477 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  26.23 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  26.23 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  32.68 
 
 
479 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  26.43 
 
 
509 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  32.68 
 
 
479 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  29.91 
 
 
479 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  26.02 
 
 
509 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  26.02 
 
 
509 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  26.23 
 
 
509 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
486 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  30.41 
 
 
486 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  31.82 
 
 
479 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
486 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.2 
 
 
486 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  30.2 
 
 
486 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  31.4 
 
 
489 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
486 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.71 
 
 
474 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
486 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.79 
 
 
490 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
486 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  30.2 
 
 
486 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.52 
 
 
474 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
486 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  31.39 
 
 
478 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  32.43 
 
 
471 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.18 
 
 
479 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  32.64 
 
 
474 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  31.35 
 
 
479 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  34.47 
 
 
478 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  28.85 
 
 
486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  30.44 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  34.48 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 
479 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  31.64 
 
 
505 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.84 
 
 
482 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  34.42 
 
 
472 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.22 
 
 
486 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  30.71 
 
 
486 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  33.99 
 
 
482 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  30.44 
 
 
480 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  30.61 
 
 
486 aa  187  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  29.39 
 
 
486 aa  187  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  30.61 
 
 
486 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  29.39 
 
 
486 aa  187  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.44 
 
 
514 aa  187  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  34.97 
 
 
467 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>