More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3471 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3471  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
471 aa  939    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169298  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3563  cardiolipin synthetase 2  47.41 
 
 
467 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.483916 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2886  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.41 
 
 
467 aa  360  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  47.42 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.64 
 
 
459 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  33.19 
 
 
468 aa  276  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  30.34 
 
 
441 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  32.56 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  37.1 
 
 
482 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3170  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.35 
 
 
458 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.93 
 
 
472 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  35.2 
 
 
502 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.75 
 
 
474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  33.01 
 
 
499 aa  196  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.97 
 
 
481 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.95 
 
 
477 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.27 
 
 
478 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.31 
 
 
485 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.55 
 
 
514 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  32.25 
 
 
482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.38 
 
 
509 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.56 
 
 
514 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.14 
 
 
472 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  26.9 
 
 
476 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.13 
 
 
514 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  32.56 
 
 
474 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.8 
 
 
474 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  31.15 
 
 
484 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
514 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  32.82 
 
 
467 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.2 
 
 
464 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.94 
 
 
509 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.1 
 
 
489 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.41 
 
 
477 aa  186  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.08 
 
 
514 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  27.29 
 
 
470 aa  186  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.71 
 
 
476 aa  186  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.49 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.92 
 
 
486 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  27.94 
 
 
509 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  30.91 
 
 
477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.72 
 
 
509 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.72 
 
 
509 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  32.85 
 
 
477 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  32.85 
 
 
477 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.61 
 
 
479 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.64 
 
 
474 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.06 
 
 
478 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  27.15 
 
 
509 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
478 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.06 
 
 
541 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  27.49 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  27.49 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.87 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  34.46 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 
479 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.82 
 
 
476 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  31.83 
 
 
477 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  30.96 
 
 
483 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.13 
 
 
479 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
483 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  32.04 
 
 
477 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.11 
 
 
486 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  26.23 
 
 
509 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  26.23 
 
 
509 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
479 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
479 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
479 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
479 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
479 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.75 
 
 
478 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
479 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  30.34 
 
 
484 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
479 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
486 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  30.59 
 
 
478 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 
484 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  26.78 
 
 
502 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  33.1 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  31.77 
 
 
505 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  28.7 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.62 
 
 
490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.79 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  28.12 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  31.85 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  28.19 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  31.77 
 
 
472 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  26.06 
 
 
483 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.46 
 
 
479 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  33.26 
 
 
486 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.04 
 
 
481 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  34.35 
 
 
479 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>