More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2455 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
463 aa  959    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  44.88 
 
 
441 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  38.82 
 
 
468 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  35.21 
 
 
482 aa  306  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3170  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.97 
 
 
458 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3471  phospholipase D/transphosphatidylase  32.56 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169298  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  30 
 
 
509 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.79 
 
 
485 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2886  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.67 
 
 
467 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3563  cardiolipin synthetase 2  30.45 
 
 
467 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.483916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
509 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
509 aa  225  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
509 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.7 
 
 
459 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
509 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.61 
 
 
509 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  29.33 
 
 
509 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.33 
 
 
509 aa  224  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.58 
 
 
509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.58 
 
 
509 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  30.57 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  32.11 
 
 
470 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.19 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.62 
 
 
526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.89 
 
 
472 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.32 
 
 
541 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  30.04 
 
 
484 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  28.89 
 
 
502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  27.08 
 
 
479 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.1 
 
 
482 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.13 
 
 
481 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  27.74 
 
 
479 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.76 
 
 
514 aa  209  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  28.6 
 
 
484 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 
514 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.98 
 
 
486 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  30.72 
 
 
477 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.55 
 
 
514 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  27.23 
 
 
479 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 
514 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  28.89 
 
 
502 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 
479 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 
479 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  27.88 
 
 
483 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 
479 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 
479 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 
479 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 
479 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 
514 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 
514 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 
514 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 
514 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 
514 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  31.97 
 
 
486 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.62 
 
 
486 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.08 
 
 
514 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  26.65 
 
 
479 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  27.4 
 
 
483 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.36 
 
 
514 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  27.18 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  28.74 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  28.31 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.93 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  27.14 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 
485 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  27.16 
 
 
483 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  27.08 
 
 
479 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.72 
 
 
476 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  27.08 
 
 
479 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30 
 
 
477 aa  200  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 
490 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 
491 aa  199  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  27.46 
 
 
474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  27.74 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  32.95 
 
 
483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  28 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  33.03 
 
 
483 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.91 
 
 
474 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 
478 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 
472 aa  196  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  29.03 
 
 
478 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  27.16 
 
 
492 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.17 
 
 
478 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  28.28 
 
 
486 aa  193  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  28.28 
 
 
486 aa  193  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  27.34 
 
 
477 aa  193  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  28.28 
 
 
486 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  29.91 
 
 
467 aa  192  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
486 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
486 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
486 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
486 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
486 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.27 
 
 
486 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
486 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  29.91 
 
 
467 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  28.27 
 
 
486 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
486 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
486 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
486 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>