69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01480 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  100 
 
 
775 aa  1623    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  41.6 
 
 
833 aa  614  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  36.22 
 
 
759 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  39.52 
 
 
1821 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  41.75 
 
 
1522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  39.49 
 
 
1783 aa  301  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  47.77 
 
 
1219 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  25.54 
 
 
780 aa  79.7  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  34.16 
 
 
818 aa  80.1  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.46 
 
 
701 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  46.84 
 
 
1103 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.69 
 
 
546 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  23.06 
 
 
801 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  22.42 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  25.23 
 
 
730 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  25 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  39.77 
 
 
270 aa  66.6  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  27.24 
 
 
518 aa  63.9  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  24.83 
 
 
512 aa  63.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  22.08 
 
 
533 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  23.78 
 
 
483 aa  61.6  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  23.78 
 
 
498 aa  61.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  25.84 
 
 
720 aa  60.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  24.92 
 
 
714 aa  60.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.67 
 
 
498 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  24.38 
 
 
510 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  25.39 
 
 
738 aa  58.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  22.02 
 
 
533 aa  58.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  29.25 
 
 
478 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  28.08 
 
 
517 aa  56.6  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  27.88 
 
 
525 aa  54.7  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.5 
 
 
474 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.18 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 
732 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  23.91 
 
 
516 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  22.34 
 
 
483 aa  51.6  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  23.91 
 
 
516 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  37.18 
 
 
732 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  37.18 
 
 
732 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.18 
 
 
502 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
491 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  27.84 
 
 
746 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  29.58 
 
 
572 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  23.87 
 
 
502 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.8 
 
 
514 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.96 
 
 
632 aa  48.5  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  41.18 
 
 
472 aa  48.5  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  34.12 
 
 
717 aa  48.5  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.83 
 
 
507 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  30.53 
 
 
504 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  39.24 
 
 
728 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  39.47 
 
 
512 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.1 
 
 
713 aa  47.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 
735 aa  47.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  31.86 
 
 
739 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  37.97 
 
 
728 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  42 
 
 
745 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.93 
 
 
521 aa  47.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  36.25 
 
 
735 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  31.86 
 
 
739 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.18 
 
 
507 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  34.18 
 
 
504 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.5 
 
 
497 aa  45.8  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  20.43 
 
 
684 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  46.81 
 
 
684 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.31 
 
 
691 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  61.76 
 
 
655 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  30.95 
 
 
482 aa  44.3  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  19.94 
 
 
724 aa  44.3  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>