223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0903 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  80.04 
 
 		 474 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 478 aa  931    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  53.26 
 
 		 518 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  48.59 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  46.32 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.02 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  45.34 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.53 
 
 		 521 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.16 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  46.15 
 
 		 735 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  49.78 
 
 		 714 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  41.51 
 
 		 714 aa  358  8e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  42.86 
 
 		 498 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  43.7 
 
 		 483 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.59 
 
 		 701 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  43.29 
 
 		 502 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.42 
 
 		 502 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  42.21 
 
 		 717 aa  336  5e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  43.7 
 
 		 732 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  39.7 
 
 		 714 aa  333  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  44.02 
 
 		 739 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  44.23 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  44.23 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  43.41 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  42.98 
 
 		 525 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  43.8 
 
 		 739 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  40.78 
 
 		 512 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.36 
 
 		 498 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.64 
 
 		 504 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  42.03 
 
 		 724 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  43.23 
 
 		 746 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  42.92 
 
 		 735 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  41.4 
 
 		 504 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  38.92 
 
 		 504 aa  300  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  40.36 
 
 		 803 aa  299  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  39.08 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  42.46 
 
 		 482 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  44.66 
 
 		 728 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  44.66 
 
 		 728 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.52 
 
 		 713 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  36.42 
 
 		 730 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  47.47 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  36.21 
 
 		 720 aa  257  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  47 
 
 		 513 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.54 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  33.41 
 
 		 738 aa  229  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.2 
 
 		 507 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.49 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  33.08 
 
 		 470 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.99 
 
 		 465 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  26.86 
 
 		 512 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.61 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 		 734 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.31 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.76 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  23.12 
 
 		 1783 aa  70.1  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  24.4 
 
 		 1821 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.84 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  27.7 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  26.89 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  29.88 
 
 		 1522 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  25.75 
 
 		 524 aa  66.6  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  22.86 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.87 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.87 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.57 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  29.3 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  25.34 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.67 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  27.39 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  27.2 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  22.45 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  29.58 
 
 		 775 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  26.58 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  21.96 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  29.51 
 
 		 684 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  20.86 
 
 		 677 aa  57  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.18 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  25.98 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.68 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  23.5 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  25.32 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.96 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  36.89 
 
 		 693 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  26.49 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.56 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  25.52 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  36.89 
 
 		 693 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  28.01 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.49 
 
 		 395 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  26.83 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  27.98 
 
 		 479 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  25.57 
 
 		 401 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.02 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  27.02 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>