223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4043 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 572 aa  1162    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  46.34 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.3 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.49 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.41 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  48.48 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  42.17 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  39.79 
 
 		 714 aa  339  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.66 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.36 
 
 		 701 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  38.49 
 
 		 498 aa  317  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  38.49 
 
 		 483 aa  317  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  39.54 
 
 		 735 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  39.12 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  39.13 
 
 		 491 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  37.15 
 
 		 714 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  36.49 
 
 		 525 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  37.71 
 
 		 512 aa  298  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  39.48 
 
 		 739 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.04 
 
 		 498 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  41.28 
 
 		 714 aa  293  8e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  39.05 
 
 		 739 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  38.11 
 
 		 732 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  38.59 
 
 		 717 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  38.32 
 
 		 732 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  38.32 
 
 		 732 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  37.84 
 
 		 502 aa  286  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.09 
 
 		 504 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.16 
 
 		 502 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  35.45 
 
 		 724 aa  280  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  36.76 
 
 		 735 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  36.4 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.21 
 
 		 713 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  37.82 
 
 		 746 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  34.01 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  35.79 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  35.77 
 
 		 482 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  32.99 
 
 		 730 aa  240  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  36.88 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  38.83 
 
 		 728 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  38.86 
 
 		 728 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.31 
 
 		 517 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.01 
 
 		 513 aa  227  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  30.7 
 
 		 803 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  32.94 
 
 		 720 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  30.59 
 
 		 738 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.95 
 
 		 507 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.65 
 
 		 507 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29.02 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.21 
 
 		 546 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 		 1522 aa  84  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  28.35 
 
 		 512 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  27.37 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  26.46 
 
 		 533 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  22.55 
 
 		 1783 aa  77  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  28.52 
 
 		 734 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  28.52 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  28.52 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  28.9 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  28.9 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  23.2 
 
 		 1821 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.83 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.21 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  26.52 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.35 
 
 		 632 aa  67  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  26.33 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.73 
 
 		 544 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.02 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  23.39 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.23 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  26.34 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  24.35 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  26.21 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  29.3 
 
 		 668 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  28.41 
 
 		 833 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  26.12 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.34 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.9 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  22.29 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  26.18 
 
 		 1219 aa  57.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  24.44 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 759 aa  57.4  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.72 
 
 		 491 aa  57  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  23.18 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  25.69 
 
 		 655 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  22.38 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.22 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  26.52 
 
 		 417 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  24.19 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.54 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.21 
 
 		 420 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  27.44 
 
 		 537 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 425 aa  53.9  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  21.82 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.26 
 
 		 483 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  22.7 
 
 		 502 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  22.81 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>