More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5587 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  71.26 
 
 		 728 aa  854    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  80.16 
 
 		 746 aa  1135    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  84.03 
 
 		 732 aa  1201    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  83.36 
 
 		 732 aa  1189    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  99.19 
 
 		 739 aa  1441    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  71.26 
 
 		 728 aa  854    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 739 aa  1457    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  53.53 
 
 		 735 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  84.03 
 
 		 732 aa  1201    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  48.14 
 
 		 735 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  43.84 
 
 		 714 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  41.48 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  43.07 
 
 		 717 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  41.93 
 
 		 714 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.26 
 
 		 713 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  38.6 
 
 		 724 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.18 
 
 		 701 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  34.74 
 
 		 803 aa  348  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.87 
 
 		 502 aa  334  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  41.56 
 
 		 518 aa  332  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  39.24 
 
 		 502 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.34 
 
 		 521 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  44.02 
 
 		 478 aa  321  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.69 
 
 		 738 aa  310  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  30.72 
 
 		 730 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.18 
 
 		 474 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.72 
 
 		 720 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  38.45 
 
 		 525 aa  303  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  40.34 
 
 		 483 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  38.17 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  38.2 
 
 		 498 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  39.48 
 
 		 572 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  39.49 
 
 		 491 aa  293  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.23 
 
 		 504 aa  289  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.52 
 
 		 503 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.45 
 
 		 498 aa  280  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  38.73 
 
 		 504 aa  280  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  36.38 
 
 		 504 aa  275  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  35.96 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  39.76 
 
 		 482 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.02 
 
 		 514 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  37.94 
 
 		 517 aa  249  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  35.15 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.53 
 
 		 507 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  43.01 
 
 		 515 aa  219  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.01 
 
 		 507 aa  217  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.35 
 
 		 517 aa  207  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.59 
 
 		 513 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  38.38 
 
 		 252 aa  144  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  42.22 
 
 		 232 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  31.03 
 
 		 470 aa  108  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  27.25 
 
 		 512 aa  94.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  42.25 
 
 		 240 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.66 
 
 		 546 aa  93.2  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  41.91 
 
 		 239 aa  91.3  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.84 
 
 		 533 aa  90.9  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.45 
 
 		 465 aa  88.6  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 		 246 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  32.48 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  29.7 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  31.76 
 
 		 533 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  31.36 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  33.54 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.36 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  22.76 
 
 		 1522 aa  77  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 		 236 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  35.48 
 
 		 235 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  33.6 
 
 		 224 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  39.37 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  36.46 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  31.95 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  36.91 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  34.87 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  29.64 
 
 		 754 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  29.64 
 
 		 754 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.64 
 
 		 734 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 236 aa  73.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.33 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  34.35 
 
 		 242 aa  72.4  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  36.8 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  36.8 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.41 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  36 
 
 		 265 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  31.47 
 
 		 245 aa  70.5  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  25.41 
 
 		 231 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  26.44 
 
 		 225 aa  69.7  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  26.46 
 
 		 264 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  35.07 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  28.02 
 
 		 623 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  38.71 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  32.12 
 
 		 149 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  25.61 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  32.16 
 
 		 722 aa  68.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.47 
 
 		 746 aa  67.8  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.35 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>