251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4028 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 518 aa  1051    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  53.93 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  53.26 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  43.39 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.99 
 
 		 521 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  44.62 
 
 		 491 aa  352  8.999999999999999e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  42.86 
 
 		 517 aa  350  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  39.31 
 
 		 714 aa  340  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.13 
 
 		 503 aa  339  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  40.96 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.82 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  41.1 
 
 		 739 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  40.75 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  41.54 
 
 		 717 aa  330  4e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.67 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  41.11 
 
 		 502 aa  329  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  40 
 
 		 525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  40.16 
 
 		 732 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  41.1 
 
 		 739 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  38.97 
 
 		 714 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  40.16 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  40.16 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  43.04 
 
 		 714 aa  322  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  39.25 
 
 		 512 aa  319  7e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  38.76 
 
 		 735 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.09 
 
 		 701 aa  316  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.82 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  41.04 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  40.97 
 
 		 746 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.41 
 
 		 504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  42.11 
 
 		 728 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  41.89 
 
 		 728 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  41.77 
 
 		 735 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  37.64 
 
 		 724 aa  290  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.82 
 
 		 713 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  37.47 
 
 		 504 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 		 504 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  36.55 
 
 		 803 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  36.83 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.03 
 
 		 517 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  35.51 
 
 		 720 aa  239  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  42.68 
 
 		 515 aa  236  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.68 
 
 		 513 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  32.94 
 
 		 730 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  33.73 
 
 		 738 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.58 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.53 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  32.44 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.73 
 
 		 512 aa  90.1  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.58 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  26.74 
 
 		 533 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  23 
 
 		 1783 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.02 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  25.93 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  26.74 
 
 		 734 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 		 1522 aa  75.1  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  27.53 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  27.53 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.59 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.24 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.24 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25.67 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  26.67 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.97 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  27.24 
 
 		 775 aa  63.9  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.15 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  23.75 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  27.08 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.71 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  26.11 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  22.56 
 
 		 759 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  24.66 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  25.19 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  25.91 
 
 		 780 aa  60.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3264  cardiolipin synthetase domain protein  22.54 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.415257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  25.72 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  25.94 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  25.69 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  23.93 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.97 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  25.54 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.94 
 
 		 677 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  25.4 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  22.2 
 
 		 1821 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.08 
 
 		 478 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2045  cardiolipin synthetase domain protein  22.06 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1905  phospholipase D/transphosphatidylase  22.71 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1860  cardiolipin synthetase  24.45 
 
 		 367 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  25.86 
 
 		 479 aa  57  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  24.28 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  26.27 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2123  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.42 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1870  cardiolipin synthetase  23.91 
 
 		 377 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0003289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.4 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  24.57 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.28 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  25.35 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>