More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1139 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 724 aa  1450    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  42.11 
 
 		 714 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  37.66 
 
 		 714 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  40.94 
 
 		 735 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  41 
 
 		 732 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  41.14 
 
 		 732 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  41.14 
 
 		 732 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  41.07 
 
 		 735 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  40.59 
 
 		 714 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  39.04 
 
 		 717 aa  446  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  39.09 
 
 		 746 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  33.66 
 
 		 730 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  39.42 
 
 		 739 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.12 
 
 		 701 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  39.56 
 
 		 739 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.42 
 
 		 713 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  40.76 
 
 		 728 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  40.62 
 
 		 728 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  37.03 
 
 		 803 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  31 
 
 		 720 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  31.97 
 
 		 738 aa  365  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  36.7 
 
 		 512 aa  321  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  40.18 
 
 		 525 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  38.69 
 
 		 502 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  38.54 
 
 		 483 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  39.19 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  39.19 
 
 		 498 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.05 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.32 
 
 		 474 aa  308  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.23 
 
 		 504 aa  306  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.61 
 
 		 521 aa  301  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  39.22 
 
 		 491 aa  300  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  37.2 
 
 		 504 aa  296  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  42.03 
 
 		 478 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.7 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  37.64 
 
 		 518 aa  290  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  35.54 
 
 		 572 aa  280  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  35.47 
 
 		 517 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  38.11 
 
 		 504 aa  268  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  39.81 
 
 		 482 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.11 
 
 		 503 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.69 
 
 		 514 aa  251  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  42.78 
 
 		 515 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  34.36 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.68 
 
 		 517 aa  239  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.59 
 
 		 513 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.51 
 
 		 507 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.65 
 
 		 507 aa  191  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  37.7 
 
 		 252 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  34.3 
 
 		 232 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  34.42 
 
 		 754 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  34.42 
 
 		 754 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  34.42 
 
 		 734 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29.1 
 
 		 470 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.7 
 
 		 546 aa  104  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  29.03 
 
 		 533 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  31.78 
 
 		 245 aa  95.1  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  29.45 
 
 		 533 aa  94.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 		 246 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.56 
 
 		 510 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.14 
 
 		 465 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  25.51 
 
 		 512 aa  90.5  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  31.67 
 
 		 516 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  31.67 
 
 		 516 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  32.2 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  28.95 
 
 		 239 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  28.34 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  30.57 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 231 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 		 229 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  27.83 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  30.67 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 		 231 aa  75.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  30.11 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  30.56 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  34.78 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  32.26 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  27.32 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.64 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  31.29 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  29.76 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  35.4 
 
 		 240 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 		 246 aa  73.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  26.83 
 
 		 713 aa  72.4  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.2 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  32.96 
 
 		 252 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.43 
 
 		 224 aa  72  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.96 
 
 		 717 aa  72  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  35.25 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.99 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.19 
 
 		 722 aa  71.2  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  22.7 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  22.7 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  24.71 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  35.2 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>