74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0396 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 818 aa  1691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  39.93 
 
 		 780 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  33.6 
 
 		 1103 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  26.21 
 
 		 1783 aa  187  9e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 		 1522 aa  178  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  29.9 
 
 		 1821 aa  134  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  96.55 
 
 		 270 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  24.95 
 
 		 833 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  23.64 
 
 		 801 aa  96.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  34.16 
 
 		 775 aa  80.1  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  32.67 
 
 		 1219 aa  73.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  24.67 
 
 		 684 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 		 655 aa  73.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  24.68 
 
 		 652 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  32.21 
 
 		 759 aa  68.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 668 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  25.55 
 
 		 681 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  23.41 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  22.56 
 
 		 676 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  45.07 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  28.82 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  32.56 
 
 		 470 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.19 
 
 		 701 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40 
 
 		 382 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  28.82 
 
 		 728 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  28.1 
 
 		 739 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.81 
 
 		 510 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  29.41 
 
 		 732 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 732 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  29.41 
 
 		 732 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.22 
 
 		 514 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.21 
 
 		 632 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 746 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  24.72 
 
 		 504 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  27.45 
 
 		 739 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  37.78 
 
 		 693 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  27.27 
 
 		 517 aa  52.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.59 
 
 		 503 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  27.78 
 
 		 735 aa  51.6  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  27.91 
 
 		 714 aa  51.2  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  40.48 
 
 		 693 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  40.48 
 
 		 693 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.75 
 
 		 533 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.33 
 
 		 546 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  27.07 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  27.57 
 
 		 803 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  28.48 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  28.48 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  24.84 
 
 		 735 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  27.39 
 
 		 416 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  27.56 
 
 		 533 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  23.86 
 
 		 730 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.39 
 
 		 507 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  30 
 
 		 473 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  28.93 
 
 		 478 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  44.9 
 
 		 745 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  26.76 
 
 		 477 aa  45.8  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  26.11 
 
 		 401 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  27.5 
 
 		 572 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  61.11 
 
 		 691 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl626  cardiolipin synthetase  27.89 
 
 		 521 aa  45.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  29.87 
 
 		 714 aa  45.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.35 
 
 		 502 aa  45.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  28.36 
 
 		 479 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.33 
 
 		 507 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  28.36 
 
 		 479 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  28.36 
 
 		 479 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  28.36 
 
 		 479 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  28.36 
 
 		 479 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  28.36 
 
 		 479 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  54.05 
 
 		 472 aa  44.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  28.36 
 
 		 479 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 502 aa  44.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  26.95 
 
 		 400 aa  44.3  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>