117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3833 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 472 aa  937    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  41.22 
 
 		 524 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  41.48 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  28.67 
 
 		 730 aa  90.1  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  31.82 
 
 		 470 aa  90.1  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  30.33 
 
 		 714 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.33 
 
 		 498 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  29.96 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  30.67 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  30.32 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  32.12 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  32.12 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  30.77 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  27.93 
 
 		 714 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 724 aa  77.8  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 717 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.86 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.62 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.21 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  32.5 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  28.53 
 
 		 803 aa  73.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  26.91 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.13 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  26.62 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  29.13 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  28.1 
 
 		 720 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  29.13 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.71 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.74 
 
 		 701 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  30.69 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  24.83 
 
 		 738 aa  71.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  30.87 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.98 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.64 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  28.1 
 
 		 735 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  27.36 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.42 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  30.22 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.17 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  30.28 
 
 		 732 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.22 
 
 		 465 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  26.15 
 
 		 512 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 732 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 732 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  30.22 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  28.62 
 
 		 735 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.74 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  32.99 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  32.99 
 
 		 754 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  32.99 
 
 		 754 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  29.58 
 
 		 746 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  29.29 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.27 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  30.1 
 
 		 714 aa  60.1  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  23.01 
 
 		 1522 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  26.12 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  32.1 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.8 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.1 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.97 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  25.35 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  21.45 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  20.47 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  24.41 
 
 		 417 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.84 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  29.35 
 
 		 1783 aa  54.3  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  25.91 
 
 		 485 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.42 
 
 		 474 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  25.97 
 
 		 1821 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  27.2 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.52 
 
 		 713 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  21.41 
 
 		 677 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  22.49 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  34.29 
 
 		 1103 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.2 
 
 		 481 aa  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  23.97 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  23.58 
 
 		 684 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  22.89 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  22.47 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.62 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  22.51 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  41.18 
 
 		 775 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  21.95 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  23.21 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.69 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.51 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  21.37 
 
 		 517 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.08 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  21.89 
 
 		 518 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.72 
 
 		 592 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  64.86 
 
 		 759 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  21.93 
 
 		 684 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  24.84 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  21.13 
 
 		 517 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  33.75 
 
 		 745 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  23.24 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.15 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  54.05 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>