More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0354 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  100 
 
 
511 aa  1047    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0345  cardiolipin synthetase  98.43 
 
 
511 aa  1032    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1291  phospholipase D/Transphosphatidylase  58.51 
 
 
509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1396  phospholipase D/transphosphatidylase  58.51 
 
 
514 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.704033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2457  phospholipase D/transphosphatidylase  51.54 
 
 
517 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000591951  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1054  cardiolipin synthetase  44.97 
 
 
531 aa  422  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.549629  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1412  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.16 
 
 
517 aa  423  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0429  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.01 
 
 
530 aa  409  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1279  cardiolipin synthetase  46.12 
 
 
449 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.624146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1331  phospholipase D/transphosphatidylase  37.7 
 
 
519 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000112238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  35.53 
 
 
502 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  35.64 
 
 
502 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  35.71 
 
 
514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  36.06 
 
 
514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  35.5 
 
 
514 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
514 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
514 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
514 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
514 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
514 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
514 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
514 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  35.71 
 
 
514 aa  280  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.11 
 
 
509 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
509 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.98 
 
 
482 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  31.85 
 
 
509 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.46 
 
 
509 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
509 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
509 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
509 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.47 
 
 
509 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  31.53 
 
 
509 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.66 
 
 
509 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.12 
 
 
492 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.76 
 
 
541 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.02 
 
 
485 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.47 
 
 
483 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  33.54 
 
 
476 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  29.75 
 
 
487 aa  249  8e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  32.99 
 
 
499 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  34.42 
 
 
476 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  32.2 
 
 
490 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
488 aa  243  6e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.67 
 
 
505 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.67 
 
 
505 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.15 
 
 
484 aa  236  7e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  30.96 
 
 
483 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl626  cardiolipin synthetase  27.08 
 
 
521 aa  231  3e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.42 
 
 
477 aa  230  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  31.87 
 
 
470 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.28 
 
 
472 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  31.85 
 
 
494 aa  227  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  31.85 
 
 
494 aa  227  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 
478 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 
477 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.25 
 
 
485 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.35 
 
 
508 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 
483 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
490 aa  223  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  31.43 
 
 
483 aa  223  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  31.08 
 
 
497 aa  221  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.11 
 
 
481 aa  220  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  29.77 
 
 
477 aa  218  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.58 
 
 
480 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.23 
 
 
526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  28.6 
 
 
484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.89 
 
 
498 aa  210  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  28.18 
 
 
473 aa  207  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.74 
 
 
463 aa  206  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  29.68 
 
 
478 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  26.2 
 
 
518 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.88 
 
 
495 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  26.33 
 
 
481 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  27.31 
 
 
481 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  26.29 
 
 
479 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  26.67 
 
 
479 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  26.5 
 
 
479 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  27.63 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  27.54 
 
 
477 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  27.54 
 
 
477 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  27.78 
 
 
479 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.35 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  29.31 
 
 
486 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.3 
 
 
486 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  27.48 
 
 
491 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.56 
 
 
490 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  27.48 
 
 
490 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  27.5 
 
 
479 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  26.14 
 
 
480 aa  193  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  28.07 
 
 
490 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  26.86 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.97 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  26.39 
 
 
478 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.62 
 
 
486 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  25.21 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  25.21 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  25.21 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  25.21 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  25.21 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>